如果劳动者不能明确证明与实际用人单位建立了劳动关系，这是一个比较棘手但并非无解的问题。以下是我根据专业知识和实务经验，为你提供的全面解答：

结论前置

在无法直接证明劳动关系时，劳动者可以从多个方面搜集证据，并通过协商、投诉、仲裁或诉讼等途径来确认劳动关系，维护自身合法权益。

具体分析

1. 搜集证据：

   • 工资支付凭证或记录：如工资条、银行转账记录等，能反映劳动者与用人单位之间的经济关联。
   • 社会保险费缴纳记录：社保缴纳记录也是证明劳动关系的重要证据。
   • 身份证件、工作证、服务证等：能证明劳动者在用人单位的工作身份。
   • 招工招聘登记表、报名表等：记录了劳动者的入职情况，是劳动关系存在的辅助证据。
   • 考勤记录：能体现劳动者在用人单位的工作时间和出勤情况。
   • 其他劳动者的证言：同事的证言也可以作为证明劳动关系的参考。

2. 与用人单位协商：

   • 在搜集到一定证据后，劳动者可以尝试与用人单位协商，要求其确认劳动关系。
   • 协商过程中，劳动者应留存好相关证据，如聊天记录、通话录音等，以备后续使用。

3. 向劳动监察部门投诉：

   • 若协商无果，劳动者可以向劳动监察部门投诉，由劳动监察部门进行调查取证。
   • 劳动监察部门有权责令用人单位提供相关证据，以确定劳动关系。

4. 申请劳动仲裁：

   • 劳动者也可以直接向劳动争议仲裁委员会申请仲裁，仲裁委将根据双方提供的证据及庭审查明的情况，依法认定是否存在劳动关系。
   • 仲裁是确认劳动关系的重要途径，劳动者应充分准备证据，积极参与仲裁过程。

5. 提起诉讼：

   • 若对仲裁结果不满意，劳动者还可以向法院提起诉讼，由法院做出最终判定。
   • 诉讼过程中，劳动者需要依据法律规定，提供充分证据支持自己的主张。

法律建议

• 劳动者在务工过程中，应尽可能保留与用人单位之间的各类往来记录，如邮件、短信、通话录音等，以便在发生纠纷时作为证据使用。
• 在搜集证据时，劳动者应注意证据的合法性、真实性和关联性，确保证据能够有力支持自己的主张。
• 若遇到复杂的劳动纠纷问题，劳动者可以寻求专业律师的帮助，以便更好地维护自身合法权益。

总之，虽然无法直接证明劳动关系会给劳动者带来一定困扰，但只要劳动者积极搜集证据，并通过合法途径进行维权，就有可能成功确认劳动关系，并获得应有的法律保障。