劳动仲裁申请撤诉的主要后果包括以下几点：

1. 仲裁程序终止：一旦申请人决定撤回仲裁申请，仲裁机构将不再对该案件进行审理和裁决，仲裁程序即告终止。这意味着，除非有新的情况或理由，否则申请人不能就同一仲裁请求再次申请仲裁。

2. 实体权利不受影响：撤诉并不会对申请人的实体权利造成改变。如果申请人的诉求在法律上有依据，即使在撤诉后，只要在法定时效内，申请人仍然可以再次申请仲裁或通过其他合法途径来维护自己的权利。

3. 费用处理：根据相关规定，申请人撤诉后，仲裁费用通常会减半收取。如果案件已经经过仲裁庭调解并达成协议后申请人再撤诉，仲裁费用则由双方当事人协商分担。

4. 可能的影响：虽然撤诉一般不会给申请人带来严重的法律后果，但它可能被视为申请人对自身权利的一种处分。在后续涉及劳动纠纷的处理中，这可能会对申请人的诉求认定产生一定作用。特别是在仲裁庭已经做了大量工作或即将作出裁决时提出撤诉，可能会浪费仲裁资源，并可能给对方当事人带来不必要的困扰。

综上所述，劳动仲裁申请撤诉是一个需要慎重考虑的决定。在做出决定前，申请人应充分了解撤诉的法律后果，并权衡利弊。如果有任何疑问或需要进一步的法律建议，请直接向我咨询。