仲裁员不能代理本仲裁委的案件。

首先，从法律角度明确，仲裁员在仲裁程序中担任的是中立第三方的角色，负责公正地审理和裁决案件。他们必须保持独立性和公正性，以确保仲裁结果的公平和公正。

其次，如果仲裁员代理本仲裁委的案件，将严重违反仲裁的公正性原则。因为代理行为意味着代表某一方当事人的利益进行仲裁活动，这与仲裁员应履行的中立职责相冲突。仲裁员应当避免任何可能损害其独立性和公正性的行为，包括代理本仲裁委的案件。

最后，从实践角度来看，仲裁机构通常也有明确的规定，禁止仲裁员代理本仲裁委的案件。这是为了维护仲裁的公信力和权威性，确保仲裁程序的公正和高效进行。

综上所述，仲裁员不能代理本仲裁委的案件，这是由仲裁员的职责、仲裁的公正性原则以及仲裁机构的实践规定所决定的。如果你对此有更多疑问或需要进一步的法律咨询，请直接向我提问。