农民工因工资问题发生冲突在拘留期间，不会影响其工资的发放。下面我来详细解释这个问题：

首先，从法律角度来看，农民工的工资是其合法劳动所得，受到法律的保护。即使农民工因工资问题与其他人发生冲突并被拘留，这并不影响其工资的发放。因为拘留是一种行政处罚或刑事强制措施，它针对的是农民工的行为，而不是其劳动所得。

其次，从实际情况出发，农民工被拘留期间，其工作单位或雇主仍然有义务按照约定的时间和方式支付工资。如果因为农民工被拘留而停止支付工资，那么这将是违反劳动法律法规的行为，农民工有权向相关部门投诉并寻求法律援助。

最后，需要指出的是，虽然农民工在拘留期间不会影响其工资的发放，但是冲突本身可能会给农民工带来一些不利的法律后果。因此，建议农民工在遇到工资问题时，应该通过合法途径来维护自己的权益，比如向劳动监察部门投诉、申请劳动仲裁或者提起劳动诉讼等。

总之，农民工因工资问题发生冲突在拘留期间，不会影响其工资的发放。但是，农民工应该通过合法途径来解决工资问题，避免不必要的法律纠纷。如果你在这方面有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。