关于二套房契税的认定标准，它主要是基于购房人及其家庭成员名下的住房数量、贷款记录以及具体的购房情况来确定的。以下是一些具体的解释和细节：

首先，二套房的基本定义是在已拥有一套住房的基础上，再次购买的住房。这个认定是以家庭为单位进行的，包括购房人、配偶及未成年子女，主要依据的是名下实际拥有的房产数量，而不是贷款情况。

在产权登记系统查询中，如果购房人家庭在当地房屋登记信息系统中已有一套或多套住房记录，那么新购住房就会被认定为二套房或更多套房。同时，虽然银行贷款记录不直接作为二套房认定的依据，但如果房屋登记系统中无房产记录而银行征信系统显示有一次住房贷款记录，再次申请贷款购房时可能会受到二套房贷款政策的限制。

另外，如果购房者名下原有一套房但已出售，且房屋登记系统和银行征信系统均无相关记录，那么再购房一般不会被视为二套房。对于在不同城市或地区购房的情况，契税的二套房认定通常是独立的，除非两地有特别的政策联动。

至于契税的税率，根据相关规定，对个人购买家庭第二套改善性住房，如果面积在90平方米及以下，会减按1%的税率征收契税；如果面积在90平方米以上，会减按2%的税率征收契税。但需要注意的是，一些特定城市如北京、上海、广州、深圳等可能不实施上述优惠政策，而是按照当地原政策执行。

总的来说，二套房契税的认定标准和税率可能会因地区和政策的不同而有所差异。因此，在购房前，我建议您最好咨询当地税务部门或专业律师以获取最准确的信息，以便合理规划税费和购房预算。