是的，事业单位行政记过处分通常会影响绩效奖金。

具体来说，行政记过处分可能导致公职人员的工资待遇调整，包括绩效奖金的减少。虽然基本工资可能不会直接降低，但相关福利和补贴可能会受到影响。此外，受处分的公职人员在处分期内还可能面临职务晋升受限、评先评优资格丧失以及培训学习机会减少等后果。

不过，具体的绩效奖金扣发情况还需参考单位内部的绩效工资方案。一般来说，单位会结合实际制定关于绩效工资分配、奖励或者扣发等情形的具体标准。因此，建议您查看所在单位的内部规定，以了解行政记过处分对绩效奖金的具体影响。

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