商品房土地有抵押，一般不影响购房者拿房产证。以下是详细解释：
一、核心结论
土地上建有商品房的，抵押土地使用权时，虽然土地被抵押，但购房者仍然可以拿到房产证。土地抵押行为本身并不构成对购房者获取房产证的障碍。
二、法律解释
土地抵押的定义：土地抵押是指土地使用权人在法律许可的范围内，在不转移土地占有的情况下，将土地使用权作为债权的担保。当债务人不履行债务时，债权人有权依法处分该土地使用权，并由处分所得的价款优先受偿。
房产证的作用：房产证是购房者拥有房屋所有权的合法凭证，它证明了购房者对房屋的占有、使用、收益和处分的权利。
两者关系：根据《中华人民共和国城市房地产管理法》等相关法律法规，购房者有权在支付全部房款或符合其他约定条件后，获得所购房屋的房产证。土地抵押与房产证的办理和发放是两个独立的过程，互不影响。
实际操作：在实际操作中，即使土地使用权被抵押给银行，开发商仍然可以为购房者办理房产证。因为房产证是基于房屋所有权而颁发的，与土地使用权的抵押状态无直接关联。只要购房者按照合同约定支付了全部房款或符合其他办证条件，开发商就有义务为购房者办理房产证。
三、注意事项
了解抵押情况：购房者在购买商品房前，应当了解该房屋所占用的土地使用权是否已被抵押。这可以通过查询相关登记信息或咨询开发商来得知。
关注合同条款：购房者在签订商品房买卖合同时，应仔细阅读合同条款，特别是关于房产证办理和土地使用权抵押的相关条款。确保自己的权益得到充分保障。
及时办理房产证：购房者在支付全部房款或符合其他办证条件后，应及时向开发商申请办理房产证。避免因拖延导致不必要的纠纷和风险。
综上所述，商品房土地有抵押并不影响购房者拿房产证。但购房者在购房过程中仍需谨慎，了解相关抵押情况，并关注合同条款，以确保自己的权益得到充分保障。如有任何疑问或需要进一步了解相关法律问题，请直接向我咨询。