员工个税在特定情况下是可以自己缴纳的。根据新修改的《中华人民共和国个人所得税法》及其实施条例，以下是一些关于个人所得税自行纳税申报的相关规定：

首先，对于取得综合所得需要办理汇算清缴的纳税人，如果符合以下条件之一，就应当依法办理汇算清缴：

1. 从两处以上取得综合所得，且综合所得年收入额减除专项扣除后的余额超过6万元；
2. 取得劳务报酬所得、稿酬所得、特许权使用费所得中一项或者多项所得，且综合所得年收入额减除专项扣除的余额超过6万元；
3. 纳税年度内预缴税额低于应纳税额；
4. 纳税人申请退税。

在这种情况下，纳税人需要在取得所得的次年3月1日至6月30日内，向任职、受雇单位所在地主管税务机关办理纳税申报，并报送相关的纳税申报表。如果纳税人没有任职、受雇单位，则需要向户籍所在地或经常居住地主管税务机关办理纳税申报。

此外，对于取得经营所得的纳税人，如个体工商户业主、个人独资企业投资者等，也需要在规定的时间内向经营管理所在地主管税务机关办理预缴纳税申报和汇算清缴。

另外，如果扣缴义务人未扣缴税款，纳税人也需要根据具体情况办理纳税申报。例如，居民个人取得综合所得的，需要按照相关规定办理汇算清缴；非居民个人取得特定所得的，也需要在规定的时间内向扣缴义务人所在地主管税务机关办理纳税申报。

总的来说，员工个税在特定情况下是可以自己缴纳的，但需要根据个人所得的类型和具体情况来确定是否需要办理自行纳税申报。同时，纳税人也需要了解相关的税收政策和规定，确保正确、及时地履行纳税义务。

对于大多数有工作单位的员工来说，平时的个人所得税通常是由单位代扣代缴的。但在办理年度个人所得税综合所得年度汇算时，纳税人可以选择自行办理、通过任职受雇单位代为办理或委托受托人办理。如果选择通过单位代为办理，纳税人需要在规定的时间内与单位进行确认，并提供相关的信息资料。如果选择自行办理或委托受托人办理，则需要按照相关规定和要求进行申报和缴税。