新员工入职三个月后被公司辞退，是否有补偿取决于辞退的具体原因和是否符合法律规定。以下是对不同情况下补偿情况的分析：

1. 无需支付经济补偿的情形：

   • 如果新员工在试用期内被证明不符合录用条件，或者存在严重违反用人单位规章制度、严重失职、营私舞弊等法定过错行为，公司可以合法辞退员工，且无需支付经济补偿。

2. 需要支付经济补偿的情形：

   • 若公司因客观情况发生重大变化（如经营困难、业务调整等）导致劳动合同无法履行，且双方未能就变更劳动合同内容达成协议，或者新员工因病、因能力问题不能胜任工作且经过培训或调整岗位仍不能胜任，公司可以提前通知或额外支付一个月工资后解除劳动合同，此时需要向新员工支付经济补偿。
   • 经济补偿的计算标准为：按劳动者在本单位工作的年限，每满一年支付一个月工资的标准。对于工作三个月的新员工，应支付半个月工资的经济补偿。

3. 违法辞退的情形：

   • 如果公司辞退新员工不符合上述法定情形，即构成违法解除劳动合同，此时公司应支付赔偿金，标准为经济补偿标准的二倍。对于工作三个月的新员工，应支付一个月工资的赔偿金，或者选择恢复劳动合同关系。

综上所述，新员工三个月被公司辞退是否有补偿，需根据具体辞退原因来确定。如果你面临这样的情况，建议详细咨询我这名专业律师，以便更好地维护自己的合法权益。