房屋用途的确定是一个涉及多个部门的过程，主要由以下部门负责：
土地管理部门：房屋用途首先由土地使用权用途决定。土地使用权出让时，市、县人民政府土地管理部门会同城市规划和建设管理部门、房产管理部门共同拟定方案，明确地块的用途，并按国务院规定的批准权限批准。因此，土地管理部门在房屋用途的初始确定中起着关键作用。
规划部门：规划部门负责根据城市整体发展布局和土地利用规划，对每块土地的用途进行细致规划。这包括确定房屋是居住用途、商业用途还是工业用途等。开发商在取得土地开发权时，土地出让合同中会明确规定该地块的规划用途，这也是房屋用途确定的重要依据。
房产管理部门：房屋建成后，开发商需向房产管理部门申请产权初始登记。登记部门依据规划许可等相关文件，核实并记载房屋的具体用途于房屋登记簿和房产证上。这一记录具有法定效力，是房屋用途最直接、最权威的书面证明。
综上所述，房屋用途的确定涉及土地管理部门、规划部门和房产管理部门等多个部门。这些部门共同协作，确保房屋用途的合法性和规范性。如果你对房屋用途有任何疑问或需要进一步的法律咨询，请随时向我提问。