首先，如果你的直属上级拿你的手机提交了离职申请，这确实是一个比较复杂且敏感的问题。以下是我对此情况的分析和建议：

1. 明确离职意愿：

   • 首先，你需要确认自己是否真的有离职的意愿。如果离职申请并非你本意，那么你需要尽快与上级和公司人力资源部门沟通，说明情况，并请求撤销离职申请。

2. 了解法律权益：

   • 从法律角度来看，如果你的上级未经你同意或授权，擅自使用你的手机提交离职申请，这可能构成对你个人权益的侵犯。你可以考虑向公司法务部门或外部法律机构咨询，了解你的法律权益和可能的救济途径。

3. 与上级沟通：

   • 无论离职申请是否是你本意，你都需要与上级进行坦诚的沟通。了解他/她为何会这样做，以及接下来的打算。如果是误会或操作失误，可以尝试协商解决；如果是故意为之，你需要考虑如何保护自己的权益。

4. 保留证据：

   • 在处理此事的过程中，务必保留好所有相关的证据，如聊天记录、邮件、短信等。这些证据在后续可能对你的权益保护起到关键作用。

5. 考虑后续行动：

   • 根据与上级沟通的结果和你的法律权益，你需要考虑采取何种后续行动。如果权益受到严重侵犯，你可以考虑向劳动仲裁机构或法院提起诉讼。

总之，面对这种情况，你需要保持冷静，明确自己的离职意愿，了解法律权益，与上级沟通，并保留好相关证据。如有需要，我会在这里为你提供进一步的法律咨询和支持。