您好，对于您提出的关于母女关系证明的问题，我理解您可能正面临需要证明母女关系但户口不在同一户口本上的情况。以下是我根据您的需求和参考信息为您提供的详细解答：
首先，即使您和您的母亲户口不在同一个户口本上，您仍然可以通过多种方式办理母女关系证明。以下是一些可用的方法：
出生医学证明：这是最直接且常用的方式。如果您的出生医学证明上明确注明了您与母亲的关系，那么这份证明就可以作为母女关系的有效凭证。
公安派出所出具的亲属关系证明：您可以前往您或您母亲户籍所在地的公安派出所，申请出具亲属关系证明。这需要您提供一些基本的身份信息和可能需要的辅助材料，如身份证、户口本（尽管不在同一户口本上，但仍需提供各自的户口本）、以及可能的其他相关证明文件。
公证部门出具的父母子女关系公证书：您也可以选择前往公证处进行公证。公证处会根据您提供的证据和材料，为您出具一份具有法律效力的父母子女关系公证书。这种方式通常需要一定的费用，并且可能需要您和您的母亲同时到场。
其他依法可以证明父母子女关系的凭证材料：除了上述方式外，还有其他一些方式可以证明母女关系，如人事档案中记载的亲属关系、法院判决书（如果涉及过相关诉讼）、具有资质的鉴定机构出具的亲子鉴定证明等。
关于办理母女关系证明是否需要双方同时到现场办理，这取决于具体的办理方式和机构要求。一般来说，如果选择公安派出所或公证处出具证明，可能需要双方同时到场以核实身份和关系。但如果是通过出生医学证明或其他已有文件来证明，则可能不需要双方同时到场。
至于办理地点，通常您可以选择在您或您母亲的户籍所在地进行办理。但具体是否支持异地办理，还需咨询当地的公安派出所或公证处等具体机构以获取准确信息。
综上所述，即使户口不在同一户口本上，您仍然有多种方式可以证明母女关系。建议您根据自己的实际情况和需要，选择最合适的办理方式，并提前咨询相关机构以了解具体的办理流程和要求。希望这些信息能对您有所帮助！