针对邻居占用耕地搭建厂房的问题，您可以通过以下途径进行举报，以确保耕地得到合理保护，同时维护您的合法权益：

一、准备举报证据

在举报之前，务必收集充分的证据，这是维权的关键。您可以采取以下措施来收集证据：

• 拍照录像：使用全景和特写镜头拍清房屋位置、面积，特别是违建与耕地边界的清晰照片或视频。
• 标注时间地点：确保照片或视频带有定位和日期信息，或使用纸条写明拍摄时间，以增强证据的有效性。
• 收集证人证言：找其他村民签字确认违建事实，增强证据的说服力。

二、选择举报渠道

您可以通过以下渠道进行举报：

• 向当地自然资源部门举报：
  • 自然资源部门是负责土地管理和监督的主要职能部门，对于土地违法行为具有明确的监管职责。
  • 您可以通过拨打当地自然资源部门的举报电话、亲自前往办公地点进行现场举报，或通过发送电子邮件的方式将问题反映给该部门。
• 向当地农业农村部门举报：
  • 如果占用基本农田建厂房的行为对农业生产造成了影响，或者涉及到农村土地的相关权益问题，您也可以向农业农村部门进行举报。
  • 举报方式同样包括电话、现场走访或电子邮件等。
• 拨打12336国土资源违法举报热线：
  • 这是全国统一的国土资源违法举报热线，专门用于受理各类土地违法行为。
  • 在拨打电话时，请清晰准确地说明违法行为发生的时间、地点、具体情况等信息。
• 借助网络平台举报：
  • 一些地方政府或相关部门会设立网络举报平台，您可以通过登录当地政府或相关部门的官方网站，查找举报板块或链接，按照提示填写举报内容，并上传相关证据材料。

三、后续跟进与处理

• 保持联系方式畅通：在举报时，请留下准确的联系电话或其他有效的联系方式，以便相关部门能够及时与您取得联系。
• 关注处理进展：您可以主动向相关部门了解举报的处理进展和结果。
• 申请行政复议或提起行政诉讼：如果对处理结果不满意，您可以在规定时间内向上级部门申请行政复议，或直接根据《行政诉讼法》将不作为的部门告上法院。

请务必确保举报内容的真实性和准确性，并积极配合相关部门的调查工作。同时，也建议您在举报过程中保持冷静和理性，避免与邻居发生不必要的冲突。