营业执照注销后，食品经营许可证并不会自动注销，需要单独申请注销。

详细解释

1. 法律独立性：

   • 营业执照是市场主体合法经营的凭证，而食品经营许可证是针对特定食品经营活动的专项许可。两者在法律上具有独立性。
   • 根据《食品经营许可管理办法》第三十七条，当食品经营者主体资格依法终止（如营业执照注销）时，应按规定申请办理食品经营许可注销手续。

2. 注销的必要性：

   • 避免法律风险：若营业执照注销后继续使用食品经营许可证，将构成无证经营，面临相关部门的处罚。
   • 维护市场秩序：及时注销不再使用的食品经营许可证，有助于市场监管部门准确掌握市场动态，维护良好的市场秩序。

3. 注销流程：

   • 提交申请：前往当地食品药品监督管理部门，提交注销申请书，并明确说明注销原因。
   • 准备材料：准备并提交相关申请材料，包括但不限于食品经营许可证的正本、副本，以及身份证复印件等其他证明文件。
   • 审核与注销：监管部门将对申请进行审核，一旦审核通过，将依法注销食品经营许可证，并可能出具注销通知书作为凭证。

4. 注意事项：

   • 在注销前，应确保已完成所有的税务清算和申报工作。
   • 遵守《食品经营许可管理办法》规定的30个工作日内向原发证部门申请注销的时限要求。

综上所述，营业执照注销后，食品经营者应主动办理食品经营许可证的注销手续，以确保合法合规，避免潜在的法律风险和维护市场秩序。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。