珠宝店开发票所需缴纳的税费并不是一个固定的百分比，而是根据具体的税收法规、店铺的经营状况以及所开具发票的金额等多种因素来决定的。不过，可以参考一些具体的规定或市场实践来给出一般性的说明。

以您提到的水贝市场为例，该市场规定商家需要支付5%的税费。这里的5%可能是指某种特定税项（如增值税、营业税等）的税率，或者是综合多种税项后的一个大致比例。然而，这并不意味着所有珠宝店在任何情况下都只需支付5%的税费。

一般来说，珠宝店在销售商品并开具发票时，需要缴纳的税费主要包括增值税、消费税（如果适用）、城市维护建设税、教育费附加、地方教育附加等。这些税费的计算方法和税率都可能有所不同，并且可能受到国家政策调整的影响。

此外，珠宝店的经营状况（如销售额、成本、利润等）也会影响所需缴纳的税费金额。如果店铺的销售额较高，那么相应需要缴纳的税费也会更多。

因此，要准确了解珠宝店开发票所需缴纳的税费金额，建议咨询专业的税务机构或会计师，他们可以根据具体的税收法规和店铺的经营状况为您提供详细的计算和解答。同时，珠宝店也应该加强财务管理和税务筹划，确保依法纳税并合理降低税负。