当企业因经营困难申请裁员时，对员工的赔偿主要遵循《中华人民共和国劳动合同法》的相关规定。以下是关于企业困难裁员时员工赔偿的详细解答：

一、赔偿的法律依据

根据《中华人民共和国劳动合同法》第四十一条，企业在生产经营发生严重困难等特定情况下，有权裁减人员。同时，该法第四十六条明确规定，用人单位因这些特定原因解除劳动合同的，应当向劳动者支付经济补偿。

二、赔偿的计算方式

1. 按工作年限计算：经济补偿的计算主要依据员工在本单位的工作年限。具体为，每满一年支付一个月工资的标准向劳动者支付经济补偿。
2. 不满一年的处理：对于工作六个月以上但不满一年的员工，按一年计算，即支付一个月工资的经济补偿；对于工作不满六个月的员工，则支付半个月工资的经济补偿。
3. 月工资的定义：这里的月工资是指劳动者在劳动合同解除或终止前十二个月的平均工资。

三、赔偿的注意事项

1. 优先留用人员：在裁员过程中，企业应当优先留用与本单位订立较长期限的固定期限劳动合同的员工，以及与本单位订立无固定期限劳动合同的员工。
2. 重新招用人员的优先权：如果企业在裁员后的六个月内重新招用人员，应当通知被裁减的员工，并在同等条件下优先招用他们。

综上所述，企业在因经营困难裁员时，必须按照《中华人民共和国劳动合同法》的相关规定，向被裁员工支付相应的经济补偿。这既是法律的要求，也是保障员工权益的重要体现。