在单位犯罪案件中，如果检察院决定对部分犯罪嫌疑人不起诉，是会告知公安机关的。下面我详细解释一下相关的法律规定和流程：

1. 法律依据：

   • 根据《刑事诉讼法》第一百七十九条，对于公安机关移送起诉的案件，人民检察院决定不起诉的，应当将不起诉决定书送达公安机关。这意味着，检察院在作出不起诉决定后，有义务将这一决定通知公安机关。

2. 通知的内容：

   • 不起诉决定书会详细载明被不起诉人的基本情况、案由、案件事实、不起诉的法律根据和理由等内容。这不仅是对被不起诉人的正式告知，也是对公安机关的一种反馈和说明。

3. 公安机关的后续行动：

   • 公安机关在收到不起诉决定书后，如果认为不起诉的决定有错误，可以要求复议。如果复议意见不被接受，还可以向上一级人民检察院提请复核。这体现了法律程序的严谨性和对公安机关意见的尊重。

4. 其他相关方的通知：

   • 除了公安机关，检察院还会将不起诉决定书送达被害人（如果有的话）。被害人如果不服，可以在收到决定书后七日以内向上一级人民检察院申诉，请求提起公诉。

综上所述，单位犯罪案件中，检察院对部分犯罪嫌疑人作出不起诉决定后，是会依法告知公安机关的。这是法律程序的一部分，也是确保司法公正和透明的重要举措。如果你还有其他关于刑事案件的问题，欢迎随时向我咨询。