应发工资不包含实际应缴纳的个人所得税金额，但它是个人所得税的计算基数。以下是详细解释：

一、应发工资与实发工资的概念

• 应发工资：是劳动者在提供了正常劳动的前提下，按照劳动合同约定的工资标准，用人单位应当支付给劳动者的全部劳动报酬，它是税前的概念。应发工资涵盖了基本工资、奖金、津贴、补贴等所有应得的收入项目，是劳动者提供劳动后应获得的税前报酬总额。
• 实发工资：则是在应发工资的基础上，扣除了包括个人所得税在内的各种税费和费用后的实际发放金额，它是税后的结果。

二、个人所得税的计算与扣除

• 个人所得税是基于应发工资来计算的，但应发工资本身并不直接包含实际应缴纳的个人所得税金额。
• 应纳税所得额是在应发工资的基础上，减去一系列法定的扣除项目（如五险一金个人缴纳部分、专项附加扣除以及每月基本减除费用5000元）后得出的。
• 根据应纳税所得额，按照适用的税率和速算扣除数计算出应缴纳的税额。
• 实发工资则是应发工资减去包括个人所得税在内的各种税费和费用后的金额。

三、实例说明

以小李为例，假设其本月应发工资为10000元，五险一金个人缴纳部分为1000元，有1000元的专项附加扣除。那么他的应纳税所得额和应纳税额计算如下：

• 应纳税所得额 = 10000 - 1000 - 1000 - 5000 = 3000元。
• 对应3%的税率，应纳税额为3000 × 3% = 90元。
• 因此，实发工资为10000 - 1000 - 90 = 8910元。

从这个过程可以看出，虽然个人所得税是基于应发工资来计算的，但应发工资并不直接包含实际应缴纳的个人所得税金额。

综上所述，应发工资是包含个人所得税计算基数的，但并未直接包含实际应缴纳的个人所得税金额。如需更多关于工资和税务的问题，可以直接向我咨询，我擅长处理劳动纠纷、公司事务以及刑事辩护等领域的法律问题。