针对您提出的高层楼顶违建物拆除问题，若业主不同意拆除，这是一个涉及法律法规与行政管理的复杂问题。以下是我为您提供的详细解答：

首先，要明确的是，违建物指的是未经所辖部门批准而私自建设的房屋建筑设施，这违反了《城镇公有房屋管理条例》等相关法律法规。对于这类违建物，建设工程所在地县级以上地方人民政府有权采取一系列措施。

当违建业主不同意拆除时，政府可以责成有关部门采取以下行动：

1. 查封施工现场：为防止违建行为继续，相关部门有权对施工现场进行查封，以遏制进一步的违法建设。

2. 强制拆除：在无法通过协商或其他方式解决的情况下，政府可以依法采取强制拆除措施。这一行动通常会在确保安全、不影响周边居民生活的前提下进行。

此外，根据《中华人民共和国城乡规划法》的相关规定，对于未取得建设工程规划许可证或未按照许可证规定进行建设的行为，县级以上地方人民政府城乡规划主管部门有权进行以下处理：

• 责令停止建设：对于正在进行的违法建设行为，主管部门可以立即责令停止。
• 限期改正与罚款：如果违法建设行为尚可采取改正措施消除对规划实施的影响，主管部门会限期改正，并处以建设工程造价百分之五以上百分之十以下的罚款。
• 限期拆除或没收：对于无法采取改正措施消除影响的违法建筑，主管部门会限期拆除。若不能拆除，则没收实物或违法收入，并可以并处建设工程造价百分之十以下的罚款。

综上所述，当高层楼顶存在违建物且业主不同意拆除时，政府及相关部门有权依法采取一系列措施进行处理。这些措施旨在维护城乡规划秩序和公共利益，确保建筑安全合法。因此，建议违建业主积极配合政府部门的拆除工作，以避免不必要的法律后果。如果业主对拆除决定有异议，可以通过法律途径进行申诉或寻求法律援助。