工厂搬迁，员工选择不去新厂区，并不直接构成自动离职。具体情况需根据工作地点变更的合理性、劳动合同的相关约定以及员工的行为和沟通情况等多个法律因素综合判断。

1. 工作地点变更的合理性：

   • 如果搬迁距离较近，对员工的工作和生活影响较小，且工厂采取了合理的弥补措施（如提供班车、交通补贴等），员工拒绝前往并持续缺勤，可能被视为无故旷工，进而按自动离职处理。
   • 若搬迁距离较远，如跨市或跨省，严重影响员工的正常生活，且工厂未提供合理解决方案，这种变更对员工来说是不合理的。员工因此拒绝前往新厂，不能算作自动离职。

2. 劳动合同的相关约定：

   • 劳动合同中若明确约定了具体的工作地点，工厂未经员工同意擅自变更，员工有权拒绝前往新址。这种情况下，员工不去新厂不应被认定为自动离职。
   • 若劳动合同对工作地点的约定较为宽泛，工厂在合理范围内搬迁时，需综合考虑搬迁对员工的影响。若搬迁对员工产生重大不利影响，且双方未能协商一致，员工拒绝前往亦不应简单认定为自动离职。

3. 员工的行为和沟通情况：

   • 员工在得知搬迁消息后，未与工厂进行任何沟通协商即不再到岗工作，可能被视为自动离职。
   • 若员工积极与工厂就搬迁事宜进行沟通，表达自己的困难和诉求，并在协商无果后才不再到新厂上班，一般不应被认定为自动离职。这表明员工并非无故旷工，而是基于合理原因拒绝前往。

综上所述，工厂搬迁后员工是否算自动离职，需根据具体情况综合判断。若您面临此类问题，建议与工厂积极沟通，并保留好相关证据，以便在必要时维护自己的合法权益。如有进一步疑问或需要法律帮助，请直接向我咨询。