结论前置：合同工请病假期间，除了扣除请假天数的工资外，再扣除本份内应该休息的两天的工资，这种做法在多数情况下是不合理的，可能违反了劳动法关于病假工资支付的规定。

分析说明：

1. 劳动法规定：根据劳动法的相关规定，员工因病请假期间，用人单位应当按照一定的标准支付病假工资。这个标准通常不低于当地最低工资标准的80%，具体数额可能因地区和企业规定而异。但无论如何，用人单位不应额外扣除员工本应休息的天数的工资。

2. 合同约定与实际情况：当然，如果劳动合同中有特别约定，比如病假期间工资支付标准有特别规定，并且这个规定不违反劳动法的强制性规定，那么用人单位可以按照合同约定执行。但根据你的描述，额外扣除本应休息的天数的工资，这并不符合一般的劳动合同约定和劳动法精神。

3. 可能的不合理情况：用人单位如果这样做，可能是出于减少成本、误解劳动法规定或故意克扣员工工资的目的。无论是哪种情况，员工都有权要求用人单位给出合理解释，并有权向劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁来维护自己的合法权益。

法律建议：

• 与用人单位沟通：首先，你可以尝试与用人单位的人力资源部门或相关负责人沟通，了解他们为什么要这样做，并提出你的质疑和不满。
• 保留证据：确保你保留了所有与病假和工资扣除相关的证据，如病假单、工资条、劳动合同等。
• 申请劳动仲裁：如果沟通无果，你可以向当地的劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁，要求用人单位按照劳动法规定支付你的病假工资。
• 法律咨询：在整个过程中，如果你有任何法律疑问或需要进一步的法律帮助，都可以直接向我咨询。

总之，用人单位额外扣除你本应休息的天数的工资是不合理的，你有权要求他们按照劳动法规定支付你的病假工资。