多层分包中实际施工人起诉的核心结论是：需根据合同相对性、突破合同相对性的例外情形，结合具体证据和法律程序，选择合适的被告主体和诉讼请求，通过诉讼维护自身权益。 具体分析如下：

1. 明确起诉对象：根据合同关系选择被告

• 直接合同相对方（转包人/违法分包人）：
  实际施工人通常与转包人或违法分包人签订了分包合同（即使合同无效），根据《民法典》第465条“合同相对性原则”，可直接起诉直接合同相对方，要求支付工程款、违约金或赔偿损失。
  示例：若A总包→B转包→C实际施工，C可直接起诉B要求付款。

• 突破合同相对性：起诉发包人（需满足法定条件）：
  根据《最高人民法院关于审理建设工程施工合同纠纷案件适用法律问题的解释（一）》第43条，实际施工人可突破合同相对性，直接起诉发包人，但需满足：

  • 发包人欠付转包人/违法分包人工程款；
    
  • 实际施工人需提供初步证据证明发包人欠付（如结算单、付款记录等）。
    注意：发包人仅在欠付工程款范围内承担责任，且需以转包人/违法分包人为共同被告。

• 多层分包中的特殊情形：
  若存在多层转包（如A→B→C→D实际施工），D可起诉直接合同相对方C，同时可申请追加B、A为第三人或共同被告，但需证明各层均存在违法分包/转包行为，且发包人（A）欠付工程款。

2. 确定诉讼请求：根据纠纷类型选择主张

• 工程款支付：
  若合同无效但工程验收合格，可依据《民法典》第793条主张参照合同约定支付工程价款；若合同有效，则按合同约定主张。

• 违约金或赔偿损失：
  若因对方违约（如拖延付款、停工等）导致损失，可主张违约金或实际损失（如材料涨价、工期延误损失等）。

• 优先受偿权（需满足条件）：
  根据《民法典》第807条，实际施工人可在工程价款范围内对工程折价或拍卖价款优先受偿，但需证明工程已竣工或具备结算条件。

3. 关键证据准备：支撑诉讼请求的实质性材料

• 合同证据：分包合同、补充协议、口头约定录音等，证明合同关系及权利义务。
  
• 履约证据：施工日志、验收报告、结算单、付款记录等，证明实际施工及工程价款。
  
• 违法分包证据：总包合同、分包审批文件、行政处罚决定等，证明分包行为违法（突破合同相对性时需用）。
  
• 发包人欠付证据：发包人与转包人的结算单、付款凭证等，证明发包人未付清工程款。

4. 诉讼程序注意事项

• 管辖法院：建设工程纠纷通常由工程所在地法院专属管辖（《民事诉讼法》第34条）。
  
• 诉讼时效：自知道或应当知道权利受损之日起3年（《民法典》第188条），建议尽早起诉。
  
• 财产保全：可申请查封发包人/转包人财产，保障执行（需提供担保）。
  
• 鉴定申请：若工程价款有争议，可申请造价鉴定，但需在举证期限内提出。

5. 风险提示与建议

• 合同无效风险：多层分包中，转包/违法分包合同通常无效，但实际施工人仍可主张工程款（需工程合格）。
  
• 发包人责任限制：起诉发包人时，需证明其欠付工程款，否则可能败诉。
  
• 证据链完整性：实际施工人常因证据不足败诉，建议施工全程留存书面记录。
  
• 协商优先：诉讼前可尝试通过发包人、行政主管部门协调，降低维权成本。

总结：多层分包中实际施工人起诉需结合合同关系、法律规定和证据情况，灵活选择被告和诉讼请求。建议根据具体案情制定策略，必要时委托律师协助梳理证据、起草文书，以提高胜诉率。如有进一步问题，可直接向我咨询。