核心结论：借调超过三年，可能涉及借调合同效力、劳动关系归属及权益保障等问题，需根据具体情况采取不同措施。以下分情况说明：

1. 若借调合同有明确期限且已到期
   根据《劳动合同法》及相关规定，借调合同应明确期限。若合同已到期且未续签，员工有权要求返回原单位工作。原单位不得无故拒绝，否则可能构成违法解除劳动关系，需承担赔偿金等责任。
   建议：员工可先与原单位、借调单位协商，明确返回时间及工作安排；若协商无果，可向劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁，主张返回原岗位或经济补偿。

2. 若借调合同未明确期限或期限超过三年
   若合同未约定期限或约定超过三年，可能被认定为“事实劳动关系”。此时，员工与原单位的劳动关系仍存续，但实际用工由借调单位履行。若借调单位未支付工资、社保等，员工可要求原单位承担责任；若原单位与借调单位互相推诿，员工可同时起诉两者。
   建议：员工应收集借调合同、工资发放记录、社保缴纳证明等证据，证明劳动关系存续及实际用工情况；通过协商、投诉或仲裁，要求原单位恢复劳动关系或支付拖欠的工资、社保等。

3. 若借调单位希望继续留用员工
   若借调单位希望员工继续留任，需与原单位、员工协商一致，重新签订借调合同或变更劳动合同。若原单位不同意，借调单位不得强行留用，否则可能构成侵权。
   建议：借调单位应主动与原单位沟通，明确留用意向及条件；若原单位拒绝，可考虑通过招聘程序正式录用员工，但需注意避免违反竞业限制等约定。

4. 若员工希望结束借调返回原单位
   员工有权根据借调合同或法律规定要求返回原单位。若原单位拒绝，员工可依据《劳动合同法》第38条，以“未按照劳动合同约定提供劳动条件”为由解除劳动合同，并要求经济补偿。
   建议：员工应提前书面通知原单位返回意向，并保留通知证据；若原单位仍拒绝，可申请劳动仲裁，主张解除合同及经济补偿。

总结：借调超过三年需根据合同约定、实际用工情况及员工意愿综合处理。建议员工、原单位及借调单位及时沟通，明确权利义务；若发生纠纷，可依据《劳动合同法》《劳动争议调解仲裁法》等法律维护权益。如有具体问题，可进一步向我咨询。