当员工自动离职时，工资的结算是一个需要细致处理的问题，它涉及到法律法规的遵循以及员工与用人单位双方的权益。以下是对这一问题的详细解答：

一、工资结算的基本原则

1. 足额支付原则： 根据《劳动法》及相关法律法规，员工有权获得其实际工作期间的全部劳动报酬。即使员工自动离职，用人单位也应按照其实际出勤天数或完成的工作量，及时、足额地支付工资。

2. 货币形式支付原则： 工资应当以货币形式按月支付给劳动者本人，确保员工能够及时收到并自由支配自己的劳动报酬。

3. 一次性付清原则： 在解除或终止劳动合同时，用人单位应一次性付清劳动者的工资，避免分期支付或拖延支付的情况。

二、工资结算的具体范围与方法

1. 正常出勤工资： 根据员工实际出勤天数，按照劳动合同约定的工资标准（如月薪、日薪等）进行计算。例如，若员工月工资为5000元，每月计薪天数为21.75天，当月正常出勤15天，则正常出勤工资为5000÷21.75×15元。

2. 加班工资： 对于员工在离职前的加班情况，用人单位需按照法律规定支付相应的加班工资。具体标准为：平时加班不低于工资的150%，休息日加班又不能安排补休的不低于工资的200%，法定休假日加班的不低于工资的300%。

3. 奖金、津贴和补贴： 只要员工满足领取条件，属于工资组成部分的奖金（如绩效奖金、全勤奖等）、津贴（如岗位津贴、交通津贴等）和补贴（如餐补等），也应一并结算支付。

三、扣除与赔偿情况

1. 经济损失赔偿： 若员工自动离职给用人单位造成了经济损失，如未完成工作交接导致的直接经济损失等，用人单位可以按照劳动合同约定或规章制度规定，从员工工资中扣除相应的赔偿金额。但需注意，每月扣除的部分不得超过员工当月工资的20%，且扣除后的剩余工资不得低于当地月最低工资标准。

2. 合法扣除项目： 对于员工在工作期间因个人原因给用人单位造成的损失，如损坏公司财物等，用人单位也可按照合法有效的规章制度从工资中予以扣除，但同样需遵守上述扣除比例和剩余工资标准限制。同时，扣款项目必须有明确依据，且不得违反法律法规。

四、特殊情况处理与注意事项

1. 工作交接未完成： 如果员工自动离职前未完成工作交接，用人单位可以暂不发放工资作为督促，但需明确告知员工并设定合理的交接期限。一旦工作交接完成，应立即发放工资。这种做法必须合法合规，不能以此为由无限期拖延工资发放。

2. 押金退还： 如果公司在员工入职时收取了押金，应在员工离职时全额退还，无论员工是否自动离职。

3. 保留证据与合法维权： 员工在离职前应确保与用人单位就工资结算问题达成一致，并妥善保留好相关证据，如工资条、出勤记录、劳动合同等。若离职后工资一直未发放或存在其他劳动争议，员工可以通过与用人单位协商、向劳动监察部门投诉、申请劳动仲裁或提起诉讼等合法途径来维护自身权益。

综上所述，自动离职的工资结算需遵循相关法律法规及企业规章制度，确保合法合规且公平合理。用人单位应依法依规进行工资结算并及时支付，确保员工的合法权益得到保障。同时，员工也应了解自己的权利和义务，在离职前与用人单位做好沟通并保留好相关证据。