关于“工厂自离扣多少天工资”的问题，结论前置：工厂在员工自离后扣除工资需严格遵循法律法规，不得随意克扣。具体扣除情况需根据员工是否给工厂造成经济损失、劳动合同及公司规章制度的具体约定来确定。以下从多个角度进行详细分析：
一、法律原则与工资支付
劳动者享有取得劳动报酬的权利：
- 根据《中华人民共和国劳动法》第五十条，工资应当以货币形式按月支付给劳动者本人，不得克扣或者无故拖欠劳动者的工资。这意味着，即使员工自离，其已提供的劳动仍应获得相应报酬。
用人单位可依法代扣费用的范围：
- 《工资支付暂行规定》第十五条明确，用人单位仅可在以下情形代扣工资：代扣个人所得税、代扣社会保险费用、法院判决要求代扣的抚养费、赡养费等，以及其他法律法规规定的代扣项目。自离本身不属于法定代扣理由，因此用人单位不得以“自离”为由直接扣减工资。
二、自离工资的合法处理方式
按实际出勤结算工资：
- 员工自离后，用人单位应根据其实际工作天数计算工资，并在解除劳动关系时一次性付清。例如，若员工当月工作10天，月工资5000元，则应支付约2298元（\(5000{\\div}21.75\\times10\)，其中21.75为月计薪天数）。
经济损失赔偿与工资扣除：
- 若因员工自离导致用人单位损失（如未交接工作造成业务延误），用人单位可通过协商或法律途径追偿。但需提供证据并遵循法定程序，而非直接从工资中扣除。若需从工资中扣除赔偿，每月扣除的部分不得超过劳动者当月工资的20%，且扣除后的剩余工资不得低于当地月最低工资标准。
旷工处理与工资扣除：
- 若公司规章制度规定旷工达到一定天数可解除劳动合同，且该制度经民主程序制定并已公示，则自离可能被视为旷工。此时，用人单位可依据制度解除劳动合同，但需支付员工实际工作期间的工资。若制度明确规定旷工期间不支付工资，则可扣除旷工日对应的薪酬，但不得克扣其他正常出勤的工资。
三、特殊情况下的工资扣除
违反服务期或竞业限制协议：
- 若员工自离违反了与工厂签订的服务期协议或竞业限制协议，工厂除要求员工支付违约金外，仍需支付员工应得的工资。违约金的支付不影响工资的正常支付，两者应分别处理。
极端情况：
- 在极少数情况下，如员工自离行为导致极其严重的后果（如泄露商业机密、故意破坏设备等），工厂可能通过法律途径追究员工的法律责任。在此情况下，工厂可暂停支付工资，但需等待法律程序的最终裁决，并根据裁决结果进行相应处理。
四、员工维权途径
- 协商：双方首先尝试协商解决争议。
- 调解：若协商不成，员工可向当地劳动争议调解委员会申请调解。
- 仲裁：调解不成的，员工可直接向劳动争议仲裁委员会申请仲裁。
- 诉讼：对仲裁结果不服的，员工可向人民法院提起诉讼。
五、建议
对用人单位：
- 完善规章制度，明确旷工及自离的处理流程。
- 及时与员工沟通，要求其办理离职手续。
- 通过合法途径追偿损失，避免随意扣薪。
对员工：
- 尽量通过书面方式提出离职申请，完成交接。
- 如遇工资被扣，保留考勤记录、工资条等证据，向劳动监察部门投诉或通过法律途径维权。
综上所述，工厂在员工自离后扣除工资需严格遵循法律法规，确保员工的合法权益不受侵害。同时，员工也应在离职时尽量遵循合法程序，以避免不必要的纠纷。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。