公司加班时间过长，劳动者完全有权申请劳动仲裁来维护自身合法权益。以下是从多个角度对此问题的详细分析：

一、法律依据

根据《中华人民共和国劳动法》及相关法律法规，国家实行劳动者每日工作时间不超过八小时、平均每周工作时间不超过四十四小时的工时制度。用人单位因生产经营需要，经与工会和劳动者协商后可延长工作时间，但一般每日不得超过一小时；特殊原因下需延长工作时间，在保障劳动者身体健康的条件下，每日不得超过三小时，且每月累计不得超过三十六小时。若公司违反此规定，即构成对劳动者合法权益的侵害，劳动者有权通过劳动仲裁途径寻求救济。

二、仲裁准备材料与事项

材料准备

1. 证明劳动关系的材料：包括但不限于劳动合同、工资条、工作证、考勤记录等，这些材料用于证明劳动者与公司的劳动关系及入职时间、岗位等信息。
2. 加班证据：这是仲裁中的关键部分，应包括加班审批表、加班打卡记录、与加班相关的工作邮件、聊天记录等，以详细证明加班的时间、天数及具体情况。
3. 仲裁申请书：应明确写明加班的详细情况、未支付加班费的具体状况以及具体的仲裁请求，如要求支付加班费、改正违法加班制度等。
4. 身份证复印件：用于确认劳动者的身份。
5. 用人单位的工商登记信息或营业执照复印件：用于确定被申请人的身份。

注意事项

1. 明确仲裁请求：劳动者在提起仲裁时，应清晰明确地提出自己的仲裁请求，包括要求支付的加班费（平时加班150%、休息日加班200%、法定休假日加班300%）以及改正违法加班制度等。
2. 仲裁时效：劳动争议申请仲裁的时效期间为一年，自劳动者知道或应当知道其权利被侵害之日起计算。因此，劳动者应及时提起仲裁申请，避免超过时效。
3. 配合仲裁委：在仲裁过程中，劳动者应积极配合仲裁委的工作，及时提交充足可靠的资料和证据，并保持与仲裁委的良好沟通，以提高仲裁效率。
4. 执行裁决：若仲裁委裁决用人单位应支付加班工资等费用，用人单位应在规定时间内履行裁决。如用人单位不履行，劳动者可向法院申请强制执行。

三、仲裁流程

1. 确定管辖机构：根据劳动合同履行地或用人单位所在地选择有管辖权的劳动争议仲裁委员会。
2. 提交申请材料：将准备好的材料提交至仲裁委员会，并等待初步审查。
3. 立案受理：符合受理条件的，仲裁委员会将在5日内立案，并通知申请人；不符合条件的，将说明理由并书面通知不予受理。
4. 案件审理：
   • 仲裁庭组成：根据案件情况组成仲裁庭，可能由1名或3名仲裁员审理。
   • 开庭通知：提前通知开庭时间、地点。
   • 庭审过程：陈述事实、出示证据、进行辩论。
5. 仲裁裁决：审理结束后，作出仲裁裁决。一般情况下，裁决在45日内作出；复杂案件可延期，但延长期限不超过15日。

四、法律要点与风险提示

1. 加班时间的认定：严格遵循法定工时制度，注意特殊工时制度的审批与公示。若公司未按规定支付加班费或安排超时加班，劳动者有权拒绝并申请仲裁。
2. 加班工资的计算：平时加班150%，休息日加班200%（不能补休），法定节假日加班300%。劳动者应根据自己的加班情况准确计算应得加班工资数额。
3. 证据收集：积极留存加班证据，确保证据的真实性和有效性。若证据不足，可能导致仲裁请求不被支持。
4. 积极配合：在仲裁过程中，提供真实信息，积极配合仲裁机构的工作。若提供虚假信息或证据，可能承担法律责任。

综上所述，公司加班时间过长时，劳动者不仅有权申请劳动仲裁，还应充分了解相关法律法规和仲裁程序，准备好充分的证据材料，并积极配合仲裁委的工作。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。