结论：对证人持有的手机进行扣押并非绝对不可，但必须满足一定条件并严格遵循法律程序。以下是对此问题的详细分析：

一、扣押的合法性及条件

根据《中华人民共和国刑事诉讼法》的相关规定，侦查机关（如公安机关、人民检察院）在侦查过程中，如果认为证人持有的手机中包含与案件有关的信息，且这些信息能够作为证据使用，证明犯罪嫌疑人有罪或者无罪，那么有权对该手机进行扣押。但这一行为必须建立在有足够证据表明手机与案件存在实质性关联的基础上，否则不得随意扣押，以保障证人的合法权益，避免对其正常生活和工作造成不必要的干扰。

二、扣押的法律程序

在扣押证人持有的手机时，侦查机关必须遵循严格的法律程序：

1. 出示证件和手续：侦查人员在进行扣押前，必须向证人出示工作证件和相应的法律文书，如搜查证、扣押决定书等，以表明执法的合法性和正当性。
2. 制作扣押清单：当场开列清单一式二份，详细记录被扣押手机的名称、型号、数量等信息，由侦查人员、见证人和证人签名或盖章。一份交给证人，另一份附卷备查，确保扣押物品的来源和去向清晰可查。
3. 妥善保管与处理：对扣押的手机应妥善保管，不得挪作他用。对不宜长期保存的物品，应按照有关规定处理。同时，应尽快查明手机与案件的关系，及时完成相关的调查取证工作。

三、证人权利保障

在扣押过程中，必须充分保障证人的合法权利：

1. 告知义务：证人应被告知扣押的理由和依据，以及其对扣押提出异议的权利。
2. 申请退还：证人应被告知如何申请退还扣押的手机。一旦确认手机中的信息与案件无关，或者已经完成了相关的调查取证工作，侦查机关应立即将手机返还给证人。

四、扣押期限与后续处理

虽然法律没有明确规定扣押证人手机的具体时间限制，但侦查机关在扣押后应尽快查明手机与案件的关系。如果手机中包含重要证据，需要进一步分析或鉴定，也应在法定时限内完成相关工作，并及时将手机返还给证人。同时，扣押的手机及其中的信息应严格按照证据使用的规定进行处理，确保其合法性和有效性。

五、实际操作中的注意事项

在实际操作中，侦查机关应谨慎行使扣押权，避免滥用职权侵犯证人权益。如果证人认为扣押行为不当或侵犯了其合法权益，可以通过法律途径进行维权，如向检察机关提出申诉或控告等。

建议：如果您或您身边的人遇到证人手机被扣押的情况，建议首先了解扣押的理由和依据，并确认是否遵循了上述法律程序。如有任何疑问或担忧，可以直接向我咨询，我会根据您的具体情况提供专业的法律意见和帮助。