证人持有的涉案财物，在符合法定条件的情况下，是可以被扣押的。以下是对这一问题的详细分析：
一、法律依据与原则
根据《中华人民共和国刑事诉讼法》的相关规定，侦查机关在侦查活动中，为了收集、固定证据，查明案件事实，有权对与案件有关的财物进行查封、扣押。这一权力行使的前提是财物必须与案件有关，且扣押行为必须符合法定程序。对于证人持有的涉案财物，如果其与案件直接相关，如作为犯罪工具、赃款赃物等，那么侦查机关在依法履行相关手续后，是有权进行扣押的。
二、扣押的条件与程序
财物与案件相关：这是扣押的基本前提。只有那些与案件有直接关联，能够证明案件事实的财物，才可能成为扣押的对象。对于证人持有的财物，如果其与案件无关，那么侦查机关是无权扣押的。
法定程序：扣押行为必须严格依照法定程序进行。这包括制作扣押决定书、出示相关证件、通知被扣押人到场、制作扣押清单等。只有程序合法，扣押行为才具有法律效力。
必要性原则：扣押行为应当遵循必要性原则，即只有在确实需要扣押该财物以查明案件事实的情况下，才能进行扣押。如果通过其他方式也能达到同样的目的，那么就不应采取扣押措施。
三、特殊情况下的处理
证人保护：在扣押证人持有的涉案财物时，应当充分考虑证人的合法权益。如果扣押行为可能对证人的生活、工作等造成严重影响，那么侦查机关应当采取相应的保护措施，如提供必要的帮助、安排临时住所等。
财物返还：如果扣押的财物在查明案件事实后，确认与案件无关或者属于证人的合法财产，那么侦查机关应当及时返还给证人。这是保护公民财产权的重要体现。
四、法律后果与救济途径
如果侦查机关在扣押证人持有的涉案财物时违反了法定程序或者侵犯了证人的合法权益，那么证人有权向相关部门提出申诉或者控告。对于违法扣押行为，相关部门应当依法进行纠正，并追究相关责任人员的法律责任。同时，证人还可以通过法律途径寻求赔偿，以维护自己的合法权益。
总结来说，证人持有的涉案财物在符合法定条件的情况下是可以被扣押的，但必须严格依照法定程序进行，并充分考虑证人的合法权益。如果您在刑事案件中遇到相关问题，或者对扣押程序、证人保护等方面有疑问，可以直接向我咨询，我会根据您的具体情况提供详细的法律解答。