结论前置：员工旷工扣工资的法律依据主要来源于《中华人民共和国劳动法》、《中华人民共和国劳动合同法》以及《工资支付暂行规定》等相关法律法规。企业应在合法合规的前提下，通过制定明确、合理且经过民主程序并公示的规章制度来确定旷工的处理方式和工资扣除标准。

详细分析：

1. 《中华人民共和国劳动法》的相关规定：

   • 第五十条：工资应当以货币形式按月支付给劳动者本人，不得克扣或者无故拖欠劳动者的工资。这奠定了工资支付的基本原则，即工资应当按时足额支付，不得随意克扣。
   • 第四十七条：用人单位根据本单位的生产经营特点和经济效益，依法自主确定本单位的工资分配方式和工资水平。这为用人单位制定奖惩制度提供了法律基础，允许用人单位在合法合规的前提下，根据自身情况制定工资分配和奖惩措施。

2. 《中华人民共和国劳动合同法》的相关规定：

   • 第四条：用人单位应当依法建立和完善劳动规章制度，保障劳动者享有劳动权利、履行劳动义务。涉及劳动者切身利益的规章制度应经职工代表大会或全体职工讨论，与工会或职工代表平等协商确定，并公示或告知劳动者。这为制定旷工扣工资等规定提供了程序上的要求，确保规章制度的合法性和合理性。
   • 第三十九条：劳动者严重违反用人单位的规章制度的，用人单位可以解除劳动合同。若旷工行为被界定为严重违纪，且规章制度经过合法程序制定和公示，则用人单位可据此解除劳动合同，这也间接支持了用人单位对旷工行为进行处罚的合法性。

3. 《工资支付暂行规定》的相关规定：

   • 第十六条：因劳动者本人原因给用人单位造成经济损失的，用人单位可按劳动合同约定要求其赔偿经济损失。经济损失的赔偿，可从劳动者本人的工资中扣除，但每月扣除的部分不得超过劳动者当月工资的20%，且扣除后剩余工资不得低于当地月最低工资标准。这一条款为旷工扣工资提供了具体的操作依据，即用人单位可以因旷工给用人单位造成的经济损失（如因旷工导致的生产损失、额外的人力成本等）而扣除工资，但扣除的比例和最低工资标准需遵守法定限制。

4. 企业内部规章制度的重要性：

   • 企业在处理旷工问题时，应依据自身制定的内部规章制度。这些规章制度应明确规定旷工的定义、处理流程、扣款标准等内容，并确保其合理性和合法性。规章制度的制定应遵循民主程序，即经职工代表大会或全体职工讨论，与工会或职工代表平等协商确定，并公示或告知劳动者，以确保其作为管理依据的合法性。

实际操作中的注意事项：

• 在扣除工资时，企业应确保扣除后的工资不低于当地最低工资标准，以维护员工的合法权益。
• 企业还应关注并遵守各地方和行业的相关法规，以确保在处理旷工问题时的全面合规性。例如，某些地方可能对旷工扣工资有更为具体的规定或限制。
• 若旷工行为严重违反规章制度，企业可依法解除劳动关系，但需确保解除过程的合法性，如提前通知、支付经济补偿等（如适用）。

举例说明：

假设某企业规定旷工一天扣除当天工资的200%（即不支付当天工资并额外扣除一天工资作为处罚），且未明确告知员工或未经民主程序制定。这样的规定可能因违反法律法规或程序不合法而被认定为无效。正确的做法应该是，企业制定明确的规章制度，规定旷工一天不支付当天工资，并明确因旷工给用人单位造成经济损失时的赔偿方式和扣除比例（如不超过当月工资的20%），同时确保这些规章制度经过民主程序制定并公示或告知员工。

综上所述，员工旷工扣工资的问题需综合考虑法律法规、企业内部规章制度以及实际操作中的多个方面。企业应在确保合法合规的前提下，制定明确、合理的规章制度，并严格按照规定执行，以保障企业和员工的双方权益。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。