劳动合同约定加班费按照最低标准计算，这一做法通常是不合法的。以下从多个角度进行分析：

1. 法律依据：

   • 根据《中华人民共和国劳动法》第四十四条的规定，有下列情形之一的，用人单位应当按照下列标准支付高于劳动者正常工作时间工资的工资报酬：
     • 安排劳动者延长工作时间的，支付不低于工资的百分之一百五十的工资报酬；
     • 休息日安排劳动者工作又不能安排补休的，支付不低于工资的百分之二百的工资报酬；
     • 法定休假日安排劳动者工作的，支付不低于工资的百分之三百的工资报酬。
   • 这里的“工资”指的是劳动者在正常工作时间内应得的报酬，而非最低工资标准。因此，劳动合同中约定加班费按照最低标准计算，显然与法律规定相悖。

2. 合同效力：

   • 劳动合同虽然是由用人单位和劳动者双方协商一致后签订的，但合同内容必须符合法律法规的规定。如果合同中的条款违反了法律法规的强制性规定，那么这些条款是无效的。
   • 在本案例中，劳动合同中约定加班费按照最低标准计算，这一条款违反了《劳动法》中关于加班费支付标准的规定，因此是无效的。

3. 实际后果：

   • 如果用人单位按照最低标准支付加班费，劳动者有权要求用人单位按照法律规定支付足额的加班费。
   • 如果用人单位拒绝支付，劳动者可以向劳动监察部门投诉，或者通过劳动仲裁、诉讼等法律途径维护自己的合法权益。

4. 特殊情况：

   • 当然，也存在一些特殊情况，比如某些特定行业或岗位可能由于工作性质、工作条件等因素，需要按照特定的方式计算加班费。但这种情况必须得到法律法规的明确授权或认可，否则仍然不能违反《劳动法》中关于加班费支付标准的基本规定。

建议：

• 对于劳动者而言，在签订劳动合同时，应仔细阅读合同条款，特别是关于加班费支付标准的条款，确保自己的合法权益得到保障。
• 如果发现劳动合同中存在违法条款，应及时与用人单位协商修改，或者向劳动监察部门投诉。
• 在实际工作中，如果用人单位未按照法律规定支付加班费，劳动者应保留好相关证据，如加班记录、工资条等，以便在需要时维护自己的合法权益。

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