加班工资确实存在诉讼时效，具体规定如下：
一、法律依据与总体原则
根据《中华人民共和国劳动争议调解仲裁法》第二十七条的规定，劳动争议申请仲裁的时效期间为一年，这一规定同样适用于加班工资的争议。但需要注意的是，在劳动关系存续期间和劳动关系终止后，这一时效的规定有所不同。
二、劳动关系存续期间
- 不受时效限制：在劳动关系存续期间，如果劳动者主张加班工资，一般不受上述一年仲裁时效期间的限制。这是因为在此期间，用人单位支付加班工资的义务是持续存在的，双方的权利义务关系相对稳定。
- 举证责任：尽管不受时效限制，但劳动者仍需对加班事实承担初步的举证责任，如提供考勤记录、工作日志、加班通知等证据来证明自己的加班情况。
三、劳动关系终止后
- 一年时效：一旦劳动关系终止，劳动者应当自劳动关系终止之日起一年内提出加班工资的仲裁申请。这是为了促使劳动者在合理期限内积极行使权利，避免证据灭失和增加维权难度。
- 时效中断与中止：
- 中断：在此一年内，如果劳动者向用人单位主张权利、向有关部门请求权利救济，或者用人单位同意履行支付加班工资的义务，这些行为均可导致时效中断，仲裁时效期间将重新计算。
- 中止：如果因不可抗力或有其他正当理由导致劳动者无法在规定的时效期间内申请仲裁，仲裁时效可以中止。从中止时效的原因消除之日起，仲裁时效期间继续计算。
四、特殊情况与注意事项
- 特殊情况：若在劳动关系持续期间内，劳动者已提出加班工资要求，而用人单位以未提交申请为由拒绝支付，劳动者提起申诉将不受一年时效性的限制。但这种情况较为特殊，需要具体分析。
- 保留证据：无论劳动关系是否存续，劳动者在主张加班工资时，都应尽可能提供充分的证据来证明加班事实的存在和加班工资的计算依据。这些证据对于维护自身合法权益至关重要。
- 了解当地政策：不同地区的劳动争议处理政策和司法实践可能存在差异。因此，劳动者在维权前应了解当地的相关政策和法规，以便更好地维护自己的权益。
五、举例说明
假设劳动者在2023年5月离职，并发现用人单位未支付其在职期间的加班工资。根据上述规定，劳动者应在2024年5月之前提出仲裁申请。如果劳动者在2023年10月向用人单位主张过加班工资，但用人单位拒绝支付，那么仲裁时效将从2023年10月起重新计算一年。
总结与建议：
劳动者在主张加班工资时，应首先明确自己与用人单位的劳动关系状态，并在规定的时效期内及时提出请求。同时，保留好相关证据是维护自身合法权益的关键。如果遇到复杂情况或疑问，可以直接向我咨询，我会根据你的具体情况提供专业的法律建议。