申请加班费确实存在诉讼时效，但需明确的是，劳动争议需先经过劳动仲裁前置程序，因此这里主要讨论的是仲裁时效，同时也会简要说明诉讼时效的相关情况。

仲裁时效

1. 一般规定：

   • 根据《中华人民共和国劳动争议调解仲裁法》第二十七条，劳动争议申请仲裁的时效期间为一年。这意味着，员工若认为用人单位未依法支付加班费，应在知道或应当知道权利被侵害之日起一年内提出仲裁申请。例如，若公司未支付2023年1月的加班费，员工在2023年2月知晓，则应在2024年2月前申请劳动仲裁。

2. 时效中断：

   • 仲裁时效可能因法定事由而中断。如果劳动者在时效期间内向用人单位主张过加班费，或者用人单位同意履行支付义务，那么仲裁时效将从中断时起重新计算。如员工在2023年6月向公司书面提出支付加班费要求，此时仲裁时效中断并重新计算一年。

3. 时效中止：

   • 因不可抗力或者有其他正当理由，当事人不能在规定的仲裁时效期间申请仲裁的，仲裁时效中止。从中止时效的原因消除之日起，仲裁时效期间继续计算。例如，在仲裁时效期间的最后六个月内发生自然灾害，导致员工无法申请仲裁，则仲裁时效中止，待灾害影响消除后继续计算。

4. 特殊情况：

   • 劳动关系存续期间因拖欠劳动报酬（包括加班费）发生争议的，劳动者申请仲裁不受一年时效限制。但劳动关系终止的，应当自劳动关系终止之日起一年内提出。即员工在职期间公司拖欠加班费，可随时申请仲裁；离职后，则需在离职之日起一年内申请。

诉讼时效

• 劳动争议案件经仲裁前置程序后，对仲裁裁决不服的，可向人民法院提起诉讼。目前法律未单独为劳动争议诉讼设置诉讼时效，但需在收到仲裁裁决书之日起十五日内提起诉讼。例如，员工在2024年1月1日收到仲裁裁决书，若对结果不服，需在2024年1月16日前向法院起诉。

实际操作建议

• 尽管法律规定了时效期限，但建议尽快处理加班费争议。随时间推移，证据收集、保存难度增加，且可能因超过时效而失去法律保护机会。
• 发现加班费争议时，应及时保留好加班通知、考勤记录、工资单等相关证据，以便在需要时支持自己的诉求。同时，也可以向我咨询具体法律程序和时效要求，以有效维护自身合法权益。

总结来说，申请加班费的仲裁时效一般为一年，但受中断、中止及特殊情况影响；诉讼时效则是在收到仲裁裁决书之日起十五日内向人民法院提起诉讼。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。