结论前置：
法律背景与解释：
付出劳动即应得报酬：根据《中华人民共和国劳动法》第五十条和《工资支付暂行规定》第九条，劳动者只要按照工厂的要求和工作安排，实际提供了劳动，无论工作时间长短，都有权利获得相应的劳动报酬。这是基于劳动的基本权益，也是法律所保障的。
“自离”不影响工资支付：“自离”通常是用人单位对员工离职方式的一种认定，但它不能成为拒绝支付工资的合法理由。即使工厂将这种情况算为“自离”，也仍需按照您实际工作的天数和双方约定的工资标准支付工资。
特殊情况下的工资扣除：如果您的“自离”行为给工厂造成了直接的经济损失，且工厂能够提供相应的证据证明，那么可以按照法律规定从您的工资中扣除相应的赔偿金额。但扣除的部分不得超过您当月工资的20%，且扣除后的剩余工资不得低于当地月最低工资标准。
法律建议：
与工厂沟通：如果您对工厂的工资支付有疑问或争议，首先应与工厂的人力资源部门或相关负责人进行沟通协商，明确您的工资计算方式和支付时间。
寻求法律帮助：若沟通无果，您可以向当地的劳动保障监察机构投诉举报，或者考虑通过法律途径来维护自己的合法权益。在此过程中，保留好相关的工作证据，如工作记录、考勤记录等，以便在需要时提供证明。
可能的法律后果：
工厂违法支付工资：如果工厂无故拖欠或克扣您的工资，根据《劳动保障监察条例》第二十六条，劳动保障行政部门将责令工厂限期支付您的工资报酬，并可能加付赔偿金。
您需承担的赔偿责任：如果您的行为确实给工厂造成了经济损失，且工厂能够提供证据证明，那么您可能需要承担相应的赔偿责任。但这一赔偿责任是有限的，且必须依法进行扣除。
总结：
您在工厂工作了6天后辞职，是有权获得这6天工资的。工厂不得以“自离”为由拒绝支付工资，除非能证明您的行为给其造成了直接经济损失，并依法进行扣除。如果您对工资支付有疑问或争议，建议与工厂沟通协商或寻求法律帮助来维护自己的合法权益。