结论前置
在建设工程合同中，税费的承担主体通常遵循法律法规的规定，即由提供建筑服务的一方（施工企业）作为法定纳税义务人。然而，实际税费承担方式可通过合同条款由双方协商确定，但此约定不能改变法定的纳税义务主体。以下是对这一问题的详细分析：
法律法规规定
法定纳税义务人：
- 根据我国税收相关法律法规，建筑工程涉及的增值税、城市维护建设税、教育费附加等税费，其纳税义务人为从事建筑服务的一方，即提供建筑工程劳务的施工企业。这些企业在提供应税建筑服务后，负有法定的申报和缴纳税款的责任。
税种及税率：
- 增值税：一般纳税人提供建筑服务，税率为9%；小规模纳税人及适用简易计税方法的一般纳税人，征收率为3%（特定时期有优惠，如自2023年1月1日至2023年12月31日，小规模纳税人适用3%征收率的应税销售收入，减按1%征收率征收）。
- 城市维护建设税：市区7%，县城、镇5%，其他地区1%。
- 教育费附加：3%。
- 地方教育附加：2%。
- 印花税：建筑工程承包合同按承包金额的0.3‰贴花。
- 企业所得税：税率为25%，符合条件的小型微利企业减按20%税率，高新技术企业减按15%税率。
合同约定与实际操作
合同约定：
- 尽管法律明确了纳税义务人，但在建筑工程实践中，税费的具体承担方式可由合同双方通过协商在合同中明确约定。例如，建设单位（甲方）和施工单位（乙方）在签订建筑工程承包合同时，可以约定税费由某一方全部或部分承担。这种约定在合同履行过程中具有约束力，但不改变法定的纳税义务主体。
实际操作：
- 在实际操作中，工程税费是根据工程结算款来计算的，并计入工程造价中。发包人在支付工程款时，通常会按照含税工程造价进行支付，除非合同另有特别约定。因此，从工程造价的角度来看，税费一般由承包人承担，并在工程价款结算时考虑进去。
合同无效时的税费承担
税收法定原则不变：
- 即使工程合同被认定无效，但在工程建设过程中实际发生的应税行为仍然产生了纳税义务。根据税法规定，符合纳税条件的主体应依法承担税费，这一义务不因合同的效力而改变。
实际履行与公平原则：
- 在合同无效的情况下，如果双方已经按照某种方式实际履行了税费缴纳义务，并且这种履行方式符合公平原则，那么可以参照实际履行情况来确定税费的承担。
过错情况：
- 当合同无效是由于双方共同过错导致时，税费损失可能需要根据各自过错的程度来分担。若合同无效是由一方的过错造成的，该过错方通常需要承担因合同无效而导致的额外税费损失。
法律建议
明确合同条款：
- 在签订建筑合同时，建议双方明确约定税费的承担方式和相关责任，以避免后续因税费问题产生的争议和纠纷。
关注税收政策变化：
- 税率及政策可能随时间变化，务必关注最新税收法规和政策动态，以确保合规纳税。
及时咨询专业律师：
- 如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，可以直接向我咨询，我将根据具体情况提供准确的法律意见。
综上所述，建设工程合同中的税费承担问题涉及多个方面，包括法律法规的规定、合同条款的约定以及实际操作中的惯例。为确保税费承担的合理性和合法性，建议在签订建筑合同时充分考虑并明确约定相关条款。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。