公务员旷工扣发工资的依据主要来源于相关法律法规及单位内部规章制度，以下从这两个方面进行详细阐述：
一、法律法规依据
《中华人民共和国公务员法》：
- 该法规定了公务员的权利与义务，以及违反义务应承担的责任。虽然直接条款可能并未明确提及“旷工扣发工资”，但公务员旷工属于违反工作纪律的行为，根据该法，单位有权依据情节轻重给予相应的处分，处分形式包括警告、记过、记大过、降级、撤职、开除等。在旷工情节严重的情况下，单位可能会采取扣发工资作为处分措施之一，尽管这通常是通过单位内部规章制度来具体实现的。
《中华人民共和国劳动法》及相关劳动法规（虽主要针对企业职工，但部分原则可参照）：
- 劳动法规定了劳动者应遵守的劳动纪律，以及违反劳动纪律应承担的责任。公务员作为国家公职人员，虽不直接适用劳动法，但劳动法中关于劳动纪律和责任承担的原则，在公务员管理中有一定的参照价值。特别是当公务员旷工行为严重违反工作纪律时，单位可依据类似原则进行处分，包括扣发工资。
二、单位内部规章制度依据
单位规章制度：
- 公务员所在单位通常会制定详细的规章制度，明确公务员的权利与义务、工作纪律、考勤管理、奖惩措施等。这些规章制度是单位对公务员进行日常管理的重要依据。
- 在规章制度中，往往会明确规定旷工的处理方式，包括扣发工资的具体标准。例如，旷工一天扣发多少比例的工资，旷工多少天将给予何种处分等。这些规定通常是根据单位的实际情况和公务员管理需要来制定的。
具体执行：
- 当公务员出现旷工行为时，单位会依据规章制度进行调查核实，并根据旷工的情节轻重和造成的后果，决定是否扣发工资以及扣发的具体比例。
- 扣发工资的决定通常会以书面形式通知公务员本人，并说明扣发的理由和依据。公务员如有异议，可以按照规定的程序进行申诉或复核。
三、建议与注意事项
公务员应严格遵守工作纪律：
- 公务员作为国家公职人员，应严格遵守工作纪律和考勤制度，按时上下班，不得无故旷工。旷工不仅会影响个人形象和职业发展，还可能面临扣发工资、处分等后果。
单位应依法依规制定规章制度：
- 公务员所在单位在制定规章制度时，应确保规章制度的内容合法合规，不得与法律法规相抵触。同时，规章制度应明确具体、可操作性强，以便在实际管理中得到有效执行。
如有争议，及时寻求法律帮助：
- 如果公务员对扣发工资的决定有异议，或者认为单位的规章制度存在违法违规情况，可以及时向相关部门或法律专业人士咨询，了解自己的权利和义务，并寻求合法的解决途径。
综上所述，公务员旷工扣发工资的依据主要来源于相关法律法规及单位内部规章制度。公务员应严格遵守工作纪律和考勤制度，单位也应依法依规制定和执行规章制度。如有任何疑问或争议，建议及时咨询法律专业人士以获取专业帮助。