教师考勤扣工资是否合法，需根据具体情况来判断，不能一概而论。以下从不同角度进行分析：

1. 合法扣减工资的情形：

   • 规章制度明确且合法：如果学校或教育机构有明确的考勤制度，并且该制度已经通过民主程序制定（如职工代表大会讨论、与工会或职工代表协商等），且内容不违反法律法规的强制性规定，同时已经向教师公示或告知，那么根据该制度对教师进行考勤扣工资是合法的。例如，制度中规定迟到、早退或旷工达到一定次数或时长，将扣除相应比例的工资，且该扣除比例合理，不超出法定限度。
   • 法定扣减情形：根据《工资支付暂行规定》等相关法律法规，因劳动者本人原因给用人单位造成经济损失的，用人单位可按照劳动合同的约定要求其赔偿经济损失。经济损失的赔偿，可从劳动者本人的工资中扣除，但每月扣除的部分不得超过劳动者当月工资的20%。若教师因考勤问题（如旷工）给学校造成经济损失，学校在符合上述条件下扣减工资是合法的。

2. 非法扣减工资的情形：

   • 规章制度不合法或未公示：如果学校的考勤制度未经民主程序制定，或者内容违反法律法规的强制性规定，或者未向教师公示或告知，那么根据该制度进行考勤扣工资就是非法的。
   • 扣减比例超出法定限度：即使学校有合法的考勤制度，但如果扣减工资的比例超出了法定限度（如每月扣除超过工资的20%），也是非法的。
   • 无合法理由扣减：如果学校没有合法的考勤制度，或者教师的考勤问题并未给学校造成经济损失，或者学校无法证明考勤问题与经济损失之间的因果关系，那么学校无权扣减教师的工资。

法律建议：

• 对于教师而言，如果遭遇非法扣减工资的情况，首先应当查看学校的考勤制度是否合法、是否已公示或告知，以及扣减工资的比例是否合理。如果认为学校的扣减行为非法，可以向学校提出异议，要求学校说明扣减的依据和理由，并要求学校纠正非法扣减行为。
• 如果学校拒绝纠正，教师可以向当地的劳动监察部门投诉，或者申请劳动仲裁，维护自己的合法权益。

可能后果：

• 如果学校非法扣减教师工资，除了需要补发被扣减的工资外，还可能面临劳动监察部门的处罚，如罚款、责令改正等。
• 如果教师因此提起劳动仲裁或诉讼，学校还可能承担仲裁费用或诉讼费用，以及因败诉而支付的其他费用（如律师费、差旅费等）。

总之，教师考勤扣工资是否合法，需根据学校的考勤制度、扣减比例以及是否给学校造成经济损失等因素综合判断。如有任何疑问或遭遇非法扣减工资的情况，请直接向我咨询，我会为你提供专业的法律帮助。