动物运输未走指定通道的处罚需根据具体违法情形及法律规定综合判定，主要涉及行政处罚，情节严重可能承担刑事责任。具体分析如下：

1. 行政处罚依据及情形
   根据《中华人民共和国动物防疫法》第五十一条规定，运输动物需经国务院农业农村主管部门指定的通道进入省、自治区、直辖市，并接受动物卫生监督检查站的查验。若未遵守该规定，县级以上地方人民政府农业农村主管部门可依据《动物防疫法》第一百零二条进行处罚：

   • 处罚措施：责令改正，处三千元以上三万元以下罚款；
     
   • 情节严重情形：若因未走指定通道导致动物疫病传播、流行等严重后果，处罚力度可能升级，包括吊销动物诊疗许可证、责令停业整顿等。

2. 刑事责任风险
   若未走指定通道运输动物的行为同时违反《中华人民共和国刑法》第三百三十七条（妨害动植物防疫、检疫罪），即存在“引起重大动植物疫情危险，情节严重”的情形，可能面临：

   • 三年以下有期徒刑或者拘役，并处或者单处罚金；
     
   • 单位犯罪的，对单位判处罚金，并对其直接负责的主管人员和其他直接责任人员依照前款规定处罚。
     典型情形：运输的动物携带重大动物疫病（如非洲猪瘟、禽流感等），且未采取有效防疫措施，导致疫病扩散风险。

3. 其他法律后果

   • 动物及运输工具处理：根据《动物防疫法》第七十六条，未走指定通道的动物可能被隔离、扑杀、销毁，运输工具可能被清洗、消毒，相关费用由违法者承担；
     
   • 信用惩戒：部分地区将此类违法行为纳入信用记录，影响企业或个人后续经营、贷款等。

建议：运输动物前务必确认目的地省份的指定通道，并提前准备动物检疫合格证明等材料。若已发生违法行为，建议立即联系当地农业农村主管部门说明情况，配合调查以减轻处罚。如有进一步疑问，可直接向我咨询具体操作流程或风险防范措施。