核心结论：事业单位未发工资时，个人部分的扣除需分情况讨论，主要取决于未发工资的原因、单位财务状况及双方协商结果。以下是具体分析：

1. 若单位因暂时资金周转困难未发工资，但承诺补发
   此时个人部分的社保、公积金等通常仍需按原比例扣除，但实际操作中可能存在两种处理方式：

   • 单位先行垫付个人部分：部分单位会从后续补发的工资中扣除个人应缴部分，确保社保、公积金缴纳不断档；
     
   • 与员工协商暂缓扣除：若员工同意，单位可能暂不扣除个人部分，待补发工资时一并扣除，但需注意这可能影响员工社保、公积金的连续缴纳记录（如医保断缴可能影响报销）。
     建议：员工应要求单位出具书面说明，明确补发时间及个人部分扣除方式，避免后续纠纷。

2. 若单位长期拖欠工资且无补发计划
   此时个人部分的扣除需结合法律程序处理：

   • 社保、公积金缴纳义务：根据《社会保险法》和《住房公积金管理条例》，单位仍需为员工缴纳单位部分，个人部分原则上应由员工承担。但若单位未发工资导致员工无力缴纳，员工可向社保、公积金管理部门投诉，要求单位补缴；
     
   • 工资追偿优先：员工可通过劳动仲裁或诉讼追讨工资，待工资到账后，单位再按比例扣除个人部分。若单位已无力支付工资，员工可申请强制执行，但个人部分可能因单位无财产而无法扣除；
     
   • 特殊情况处理：若单位进入破产程序，员工工资和社保、公积金个人部分属于优先受偿范围，但实际执行中可能因资产不足而难以全额清偿。
     建议：员工应尽快通过法律途径追讨工资，并同步向社保、公积金管理部门反映情况，要求单位补缴。

3. 若单位恶意拖欠工资或拒不扣除个人部分
   这可能涉及违法行为：

   • 未发工资：根据《劳动合同法》，单位拖欠工资的，员工可解除劳动合同并要求经济补偿；
     
   • 未代扣个人部分：若单位未从工资中扣除个人社保、公积金部分，员工可要求单位补扣，或向税务、社保部门投诉（因个人部分通常由单位代扣代缴）。
     建议：员工应收集工资条、劳动合同等证据，向劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁，维护自身权益。

总结：事业单位未发工资时，个人部分的扣除需根据单位财务状况、双方协商结果及法律程序综合判断。员工应优先通过法律途径追讨工资，并同步关注社保、公积金的缴纳情况，避免因断缴影响权益。如有具体问题，可进一步向我咨询。