若复议机关对申请人的补充意见不复议并因此造成了严重损失，申请人可以采取以下措施来维护自己的合法权益：

1. 了解复议程序及规定：

   • 首先，申请人需要明确行政复议的基本程序和规定。根据《中华人民共和国行政复议法》的相关规定，复议机关在收到复议申请后，应在法定期限内进行审查并作出决定。若复议机关未对补充意见进行复议，可能涉及程序违法或未履行法定职责。

2. 与复议机关沟通：

   • 申请人可以尝试与复议机关进行沟通，了解未对补充意见进行复议的具体原因。如果是由于材料不全或程序问题，申请人可以及时补充材料或纠正程序错误，以便复议机关能够重新进行审查。

3. 申请行政复议监督或提起行政诉讼：

   • 行政复议监督：如果复议机关无正当理由拒绝复议或未在法定期限内作出决定，申请人可以向上一级行政机关或相关监督机构申请行政复议监督，要求其督促复议机关履行职责。
   • 行政诉讼：若复议机关的行为严重侵犯了申请人的合法权益，且无法通过行政复议监督解决，申请人可以向人民法院提起行政诉讼，要求法院判决复议机关履行复议职责或确认其不作为违法，并可能要求赔偿因此造成的损失。

4. 收集证据并准备法律文书：

   • 在采取上述措施前，申请人应尽可能收集与案件相关的所有证据，包括复议申请书、补充意见、复议机关的回复（如有）、沟通记录等。
   • 同时，申请人可能需要准备法律文书，如行政复议监督申请书、行政诉讼起诉状等，以便在需要时向相关机构提交。

5. 考虑法律后果及赔偿问题：

   • 如果复议机关的不作为确实导致了申请人的严重损失，且该损失与复议机关的行为存在因果关系，申请人在提起行政诉讼时，可以一并要求复议机关承担赔偿责任。
   • 赔偿范围通常包括直接经济损失和可能的间接经济损失，但具体赔偿金额和范围需由法院根据案件具体情况进行判决。

行动建议：

• 鉴于行政复议和行政诉讼涉及复杂的法律程序和规定，建议申请人在采取任何行动前，先咨询专业律师（即我，张巧姣律师，专注于劳动纠纷、婚姻家庭、经济纠纷、交通事故、刑事辩护、合同纠纷、房产纠纷领域）的意见，以确保自己的权益得到充分保护。
• 同时，申请人应保持冷静和理性，通过合法途径维护自己的权益，避免采取过激或违法的行为。