结论前置：员工入职体检费用由用人单位在转正后报销，这一做法本身并不直接违反法律规定，但具体是否合法需结合实际情况和相关法律法规来综合判断。

详细分析：

1. 法律法规依据：

   • 根据《中华人民共和国劳动法》及相关规定，用人单位在招聘过程中应当遵循公平、公正、公开的原则，不得要求劳动者承担与招聘无关的费用。然而，对于入职体检费用，法律并未明确规定必须由哪一方承担。
   • 在实际操作中，入职体检费用通常被视为招聘过程中的一项必要开支，其承担方式往往由用人单位和劳动者在劳动合同或招聘协议中约定。

2. 用人单位报销的合法性：

   • 如果用人单位在招聘时明确告知劳动者，入职体检费用将由用人单位在劳动者转正后报销，并且这一约定被写入劳动合同或招聘协议中，那么这种做法是合法的。因为双方已经就体检费用的承担方式达成了合意，且该合意不违反法律法规的强制性规定。
   • 如果用人单位在招聘时未明确告知劳动者体检费用的承担方式，或者在劳动者入职后单方面决定报销体检费用，虽然这种做法可能出于善意或管理需要，但严格来说，它并不直接受法律保护。不过，只要这种做法不损害劳动者的合法权益，且双方能够协商一致，通常也不会引发法律纠纷。

3. 潜在风险与建议：

   • 对于用人单位而言，如果决定报销入职体检费用，最好在招聘时明确告知劳动者，并将相关约定写入劳动合同或招聘协议中，以避免后续纠纷。
   • 对于劳动者而言，如果用人单位提出报销入职体检费用，应仔细阅读劳动合同或招聘协议中的相关条款，确保自己的权益得到保障。如果用人单位未明确告知或拒绝报销，劳动者可以与用人单位协商解决，或者根据相关法律法规维护自己的合法权益。

特殊情况说明：

• 如果用人单位以报销体检费用为条件，要求劳动者在入职前支付体检费用，并在劳动者未转正时拒绝报销，这种做法可能涉嫌欺诈或不当得利，劳动者有权依法维权。
• 如果体检费用过高或存在不合理收费情况，劳动者也有权拒绝支付或要求用人单位承担相应费用。

总结与建议： 员工入职体检费用由用人单位在转正后报销的做法本身并不违法，但具体是否合法需根据双方约定和实际情况来判断。为了避免后续纠纷，建议用人单位在招聘时明确告知劳动者体检费用的承担方式，并将相关约定写入劳动合同或招聘协议中。如果劳动者对此有疑问或担忧，可以直接向我咨询相关法律问题。