关于土地部门安排第三方为当事人作出地籍确权调查资料是否合法的问题，这主要取决于具体的操作流程和法律依据。以下是我为您提供的详细解答：

首先，我们需要明确的是，地籍确权调查是不动产登记的前提和基础，它涉及到土地权属的确定和争议处理，因此必须严格遵循相关法律法规进行。

一、法律法规依据

1. 《中华人民共和国土地管理法》：该法规定了土地所有权和使用权争议的处理方式，明确由人民政府处理，并可以指定专门机构或人员负责办理争议案件有关事宜。这为土地部门委托第三方进行地籍确权调查提供了法律基础。

2. 《土地权属争议调查处理办法》：该办法进一步明确了县级以上国土资源行政主管部门负责土地权属争议案件的调查和调解工作，并可以指定专门机构或人员负责。这同样支持了土地部门委托第三方进行调查的做法。

3. 《海南省土地权属确定与争议处理条例》（以海南省为例，其他地区可能有类似规定）：该条例也规定了土地所有权和使用权由县级以上人民政府确定，自然资源和规划主管部门具体承办，并可以委托相关机构进行调查和调解。

二、第三方调查的合法性

1. 委托权限：土地部门在委托第三方进行地籍确权调查时，必须明确委托权限和范围，确保第三方在委托范围内进行调查，不得超出权限。

2. 调查程序：第三方在进行调查时，应遵循相关法律法规规定的程序，如实地核定土地权属界线、查验有关权属证明和其他有关材料、进行现场检查、制作检查笔录等。

3. 成果使用：第三方完成的调查成果应作为土地部门处理土地权属争议或进行不动产登记的依据之一，但必须经过土地部门的审核和确认。

三、实际操作中的注意事项

1. 选择合格的第三方：土地部门应选择具有相应资质和经验的第三方机构进行调查，确保调查结果的准确性和可靠性。

2. 监督与指导：土地部门应对第三方的调查工作进行监督和指导，确保其按照法律法规和委托要求进行调查。

3. 保护当事人权益：在进行调查时，应充分保护当事人的合法权益，如告知当事人调查事由与权利义务、听取当事人意见等。

四、具体案例分析

以屯昌县为例，该县自然资源和规划局委托屯昌县土地确权和纠纷调处中心实施土地领域行政其他（调查、调解）工作，包括土地权属确定及土地权属争议案件的调查、调解工作等。这一做法是符合相关法律法规规定的，因为该中心作为受托单位，在委托权限内规范开展行政检查工作，并接受委托单位的指导和监督。

综上所述，土地部门安排第三方为当事人作出地籍确权调查资料是合法的，但必须遵循相关法律法规规定的程序和要求，确保调查的合法性和准确性。如果您对此仍有疑问或需要进一步的帮助，请随时咨询。