针对您提出的“企业法人只有社保不发工资是否合法”的问题，这确实是一个涉及法律、税务及公司管理多个层面的复杂议题。以下是我为您提供的详细解答：
一、法律层面分析
劳动关系与工资支付：
- 根据《中华人民共和国劳动合同法》，如果企业法人（即法定代表人）实际上为公司提供了劳动，那么公司应当与其签订书面劳动合同，并按照合同约定支付工资。未支付工资的，法定代表人有权通过劳动仲裁或诉讼等途径维权。
- 若法定代表人不在公司实际提供劳动、不参与公司日常经营管理，那么其不领取工资在法律上可能是合理的，但公司仍需为其缴纳社保，这是法定义务。
社保缴纳与劳动报酬的关系：
- 社保缴纳是公司的法定义务，不能替代劳动报酬的支付。即使公司为法定代表人缴纳了社保，也不能免除其支付工资的义务（如存在劳动关系）。
特殊情况考量：
- 如果法定代表人为退休人员或与公司不存在劳动关系等特殊情况，可能不涉及工资支付问题，但这需要根据实际情况及相关规定进行核实确定。
二、税务层面分析
- 个人所得税：由于法定代表人没有工资收入，在工资薪金所得方面无需缴纳个人所得税。但需注意其他应税收入，如劳务报酬等，需按规定缴税。
- 企业所得税：公司为法定代表人缴纳的社保费用，在符合规定的情况下，可在企业所得税前扣除。
三、潜在风险与建议
劳动纠纷风险：
- 若法定代表人实际上提供了劳动却长期不领取工资，可能引发劳动纠纷，要求公司支付工资及经济补偿。
税务风险：
- 税务机关可能对公司不合理的工资待遇进行纳税调整，要求补缴税款及滞纳金，甚至罚款。
社保审计风险：
- 社保部门审计时，若发现法定代表人只缴纳社保不领工资的情况不符合常理，可能要求公司提供说明和证明材料，面临社保补缴及罚款风险。
四、综合建议
- 明确身份与职责：公司和法定代表人应明确其身份与职责，确保法定代表人是否实际提供劳动、是否参与公司日常经营管理等关键信息清晰明确。
- 遵守法律法规：公司应严格遵守《中华人民共和国劳动合同法》、《中华人民共和国社会保险法》等相关法律法规，按时足额支付工资和缴纳社保。
- 保留证明材料：公司和法定代表人应保留好相关证明材料，如劳动合同、工资支付记录、社保缴纳证明等，以应对可能出现的风险。
- 合理规划税务：公司应合理规划税务，确保税务申报合规，避免税务风险。
综上所述，企业法人只有社保不发工资的行为在大多数情况下是不合法的，除非存在特定条件（如法定代表人不在公司实际提供劳动、不参与公司日常经营管理等）。公司应依法为法定代表人及其他员工缴纳社保，并按时足额支付工资，以避免法律风险和维护劳动关系的稳定。