店里员工若未持有健康证被查到，将依据所在行业及违规情节面临不同程度的处罚。为确保合法合规经营，店主应督促员工及时办理健康证并定期进行健康检查。以下是对这一问题的详细分析：
一、餐饮行业处罚规定
在餐饮行业中，员工持健康证上岗是保障食品安全的重要一环。根据《中华人民共和国食品安全法》的相关规定：
初次违规：若食品生产经营者安排未取得健康证明或患有国务院卫生行政部门规定的有碍食品安全疾病的人员从事接触直接入口食品的工作，将由县级以上人民政府食品安全监督管理部门责令改正，并给予警告。
拒不改正：若经营者拒不改正上述违规行为，将面临五千元以上五万元以下的罚款。
情节严重：在情节严重的情况下，如多次被查出或引发食品安全事故等，经营者还可能被责令停产停业，直至吊销许可证。
二、公共场所行业处罚规定
在公共场所行业中，如宾馆、饭店、理发店、美容店等，员工持健康证上岗同样至关重要。依据《公共场所卫生管理条例》及其实施细则：
初次违规：若公共场所经营者安排未获得有效健康合格证明的从业人员从事直接为顾客服务工作，将由县级以上地方人民政府卫生计生行政部门责令限期改正，给予警告，并处以五百元以上五千元以下罚款（部分地区可能执行二百元以上二千元以下的罚款标准，具体依当地政策而定）。
逾期不改正：若经营者逾期不改正上述违规行为，将面临五千元以上一万五千元以下的罚款。若造成公共场所卫生质量不符合卫生标准和要求，且情节严重的，可依法责令其停业整顿，直至吊销卫生许可证。
三、综合建议与注意事项
及时办理健康证：店主应确保所有员工在上岗前取得有效的健康证明，这是避免处罚的第一步。
定期健康检查：除了初次办理健康证外，店主还应定期组织员工进行健康检查，确保员工健康状况符合从业要求。
合规经营意识：店主应增强合规经营意识，了解并遵守相关法律法规，为顾客提供更加安全、卫生的服务环境。
关注地区差异：不同地区在具体执法过程中可能存在一定差异，店主应关注当地政策动态，确保店铺经营符合当地要求。
总结来说，店里员工未持健康证上岗不仅违反法律法规，还可能对店铺的声誉和经济效益造成严重影响。因此，店主应高度重视员工健康证的管理，确保店铺合法合规经营。若您在经营过程中遇到任何法律问题或需要进一步的法律建议，请随时向我咨询。