员工旷工期间，其未休的年假通常不会因此被剥夺或自动作废，但具体处理方式需结合公司规章制度及实际情况来判断。以下是从不同角度对此问题的详细分析：

1. 年假的基本规定：

   • 根据《职工带薪年休假条例》的规定，职工在连续工作满一定年限后，享有带薪年休假的权利。年假的天数根据职工的工作年限来确定，与是否旷工无直接关系。
   • 年假是职工的合法权益，除非职工自愿放弃或因特定原因（如严重违反公司规章制度被解除劳动合同）而失去享受年假的资格，否则公司不得随意剥夺。

2. 旷工对年假的影响：

   • 旷工本身不直接导致年假作废：旷工是职工违反公司考勤制度的行为，公司可以根据规章制度对旷工职工进行相应的处罚，如扣发工资、警告、记过等。但旷工并不直接导致职工未休的年假作废或失效。
   • 公司规章制度可能有的规定：有些公司可能会在规章制度中规定，如果职工旷工达到一定天数或次数，将视为自动放弃当年度的年假。然而，这样的规定必须合法、合理，并且已经向职工明确告知或公示，否则可能不具有法律效力。

3. 实际操作中的建议：

   • 对于公司：公司应制定合法、合理的规章制度，明确年假的享受条件、旷工的处理方式以及年假与旷工之间的关系。在处理旷工职工时，应严格按照规章制度执行，并确保程序的合法性和公正性。
   • 对于员工：如果员工因旷工而担心年假问题，建议首先查阅公司的规章制度，了解年假和旷工的具体规定。如果认为公司的处理方式不合法或不合理，可以向公司提出异议或寻求法律援助。

4. 可能的法律后果：

   • 如果公司未经合法程序或未向职工明确告知就擅自剥夺职工的年假权利，职工有权向劳动监察部门投诉或提起劳动仲裁，要求公司恢复其年假权利或给予相应的补偿。
   • 如果职工因旷工被公司解除劳动合同，且公司规章制度中明确规定了旷工与年假的关系，那么职工可能失去当年度的年假权利。但即便如此，公司也应确保解除劳动合同的程序合法，并支付职工应得的工资和经济补偿。

总结来说，员工旷工期间其未休的年假通常不会因此被剥夺或自动作废。但具体处理方式需结合公司规章制度及实际情况来判断。如果对此有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。