针对您提出的“签怀孕主动离职是否合法”的问题，我们可以从以下几个方面进行详细分析：
首先，要明确的是，劳动者有权根据自己的意愿选择是否离职，但这并不意味着所有离职协议都是合法的。特别是在孕期这一特殊时期，劳动者的权益受到法律的特殊保护。
孕期劳动者的权益保护：
- 根据我国相关劳动法律法规，如《中华人民共和国妇女权益保障法》、《中华人民共和国劳动合同法》等，用人单位不得因女职工怀孕、生育、哺乳等原因降低其工资、予以辞退或与其解除劳动合同。这是对孕期女职工的特殊保护，旨在确保她们在孕期的合法权益不受侵害。
自愿离职的合法性：
- 一般情况下，劳动者自愿离职是其个人选择，法律对此并无过多限制。但是，如果用人单位通过欺诈、胁迫等手段迫使劳动者“自愿”离职，以规避应支付的经济补偿，那么这种“自愿”离职并不是劳动者的真实意思表示，劳动者有权要求用人单位支付相应的经济补偿。
您的情况分析：
- 在您所描述的情况中，单位拖欠工资且不缴社保，已经违反了劳动法律法规。此时，单位提出以发放拖欠工资为条件，要求您的妻子签订“自愿离职”协议，且不能要求任何经济补偿，这很可能构成对劳动者的欺诈或胁迫。
- 如果您的妻子在孕期内被辞退，用人单位应依照经济补偿标准的两倍向劳动者支付赔偿金。因此，主动签订“自愿离职”协议将可能导致您的妻子失去这一合法权益。
建议：
- 在未拿到工资之前，不建议签订该“自愿离职”协议。您可以与单位协商解决问题，要求单位支付拖欠的工资并补缴社保。
- 如果无法协商一致，您可以向当地劳动监察大队反映情况，寻求法律援助。
- 如果问题仍然无法解决，您可以向单位所在地的仲裁委员会申请仲裁，以维护自己的合法权益。
综上所述，签怀孕主动离职并不一定是合法的，特别是当这种离职并非劳动者的真实意愿，而是受到用人单位的欺诈或胁迫时。因此，在面临此类情况时，劳动者应谨慎对待，并寻求法律援助以维护自己的合法权益。