公司非法经营时，员工是否需要承担责任并非一概而论，而是取决于员工在违法行为中的具体角色、行为以及知情程度。以下是对此问题的详细分析：
一、员工无需承担责任的情况
不知情且未参与：
- 如果员工对公司的违法经营活动并不知情，且在日常工作中仅按照公司的正常安排和操作流程进行工作，没有实施任何协助或参与违法经营的行为，那么员工通常不需要对公司的违法经营行为承担法律责任。例如，一名普通的行政文员，如果对公司业务部门的走私活动毫不知情，则无需为此担责。
及时举报：
- 如果员工在发现公司的违法行为后，立即向相关部门进行了举报，那么员工不仅无需承担责任，还可能受到法律的保护。这体现了员工对法律的尊重和对公司违法行为的抵制态度。
二、员工可能需要承担责任的情况
主观上明知且参与：
- 若员工明确知道公司的经营活动违法，却仍然积极参与其中，那么员工可能需要根据其参与程度和违法行为的性质承担相应的法律责任。这包括民事责任、行政责任和刑事责任。例如，生产假冒伪劣产品导致消费者受伤时，参与生产的员工需与公司共同赔偿；财务人员明知公司偷税漏税并协助制作虚假报表，可能会受到税务机关的处罚；业务人员明知公司从事非法集资活动仍积极参与，可能会因非法吸收公众存款罪等相关罪名被追诉。
负有特定职责但未履行：
- 部分员工由于在公司中担任特定职务，如合规专员、法务人员等，负有相应的管理、监督或法律审查等职责。如果这些员工未能履行其职责，导致公司违法经营行为的发生或持续，他们也可能因此承担法律责任。这种责任可能基于失职、玩忽职守或渎职等行为而产生。例如，合规专员未对公司业务进行合规审查，导致公司违法经营，合规专员可能需要承担相应的法律责任。
达到刑法规定的犯罪情节标准：
- 即便员工并非主动参与非法经营活动的策划，但如果其在非法经营活动中的行为达到了刑法规定的犯罪情节标准（如涉案金额巨大、影响恶劣等），也可能被追究责任。例如，员工虽然只是按照上级指示进行非法经营活动的具体操作，但如果其操作行为导致了严重的后果，且达到了刑法规定的犯罪情节标准，那么该员工也可能需要承担刑事责任。
三、法律建议
了解并遵守法律法规：
- 员工应时刻保持对法律法规的敬畏之心，了解并遵守与公司业务相关的法律法规，避免因为无知而卷入公司的违法经营活动。
积极履行职责和义务：
- 员工应积极履行自己的职责和义务，对于公司可能存在的违法行为保持警惕，并及时向上级或相关部门报告。
及时举报违法行为：
- 如果员工发现公司存在违法行为，应及时向相关部门进行举报，以保护自己免受牵连，并维护社会的公平正义。
综上所述，公司在违法经营时，员工是否需要承担责任取决于多种因素。作为员工，应时刻保持警惕，了解并遵守法律法规，积极履行自己的职责和义务，并在发现公司违法行为时及时举报。如果你有任何具体的法律问题或疑虑，可以直接向我咨询，我会根据你的具体情况提供详细的法律建议。