结论：小股东退股时，大股东让拿货抵现是否合法，需根据具体情况判断，包括公司章程、股东协议的约定以及货物价值评估的合理性等。以下从不同角度进行分析：
一、公司章程与股东协议的约定
有约定的情况：
- 如果公司章程或股东协议中明确规定了股东退股时的处理方式，包括是否可以以货物抵现，以及货物价值如何确定等，那么应当遵循这些约定。
- 在此情况下，如果大股东提出的拿货抵现方案符合公司章程或股东协议的约定，且货物价值评估合理，那么这种处理方式是合法的。
无约定的情况：
- 如果公司章程或股东协议中没有明确规定股东退股时的处理方式，那么需要依据相关法律法规和公平原则来处理。
- 在此情况下，大股东不能单方面决定以货物抵现，而应与小股东协商一致，并确保货物价值评估的公正性和合理性。
二、货物价值评估的合理性
评估方法：
- 货物价值应当通过合理的评估方法来确定，如市场价值评估、成本法评估等。
- 评估过程应当公开透明，确保双方对货物价值有共同的认识。
评估结果：
- 如果评估结果显示货物价值与小股东应得的退股款项相当，且小股东同意接受货物作为退股款项的支付方式，那么这种处理方式是合法的。
- 如果评估结果显示货物价值明显低于或高于小股东应得的退股款项，且双方无法就货物价值达成一致，那么这种处理方式可能引发纠纷，甚至不合法。
三、法律法规的遵循
公司法规定：
- 根据《公司法》的相关规定，股东退股应当遵循公司章程和法律法规的规定，不得损害公司和其他股东的利益。
- 如果大股东提出的拿货抵现方案违反了公司法或相关法律法规的规定，如强制小股东接受不合理的货物价值等，那么这种处理方式是不合法的。
公平原则：
- 在处理股东退股事宜时，应当遵循公平原则，确保双方的权利和义务得到平衡。
- 如果大股东利用优势地位强迫小股东接受不合理的拿货抵现方案，那么这种处理方式可能违反公平原则，甚至构成违法行为。
四、建议与风险提示
建议：
- 在处理股东退股事宜时，建议双方先查阅公司章程和股东协议，了解相关约定。
- 如果无约定或约定不明确，建议双方协商一致，并寻求专业评估机构对货物价值进行评估。
- 在协商和评估过程中，建议保持公开透明，确保双方对处理方式有共同的认识。
风险提示：
- 如果大股东提出的拿货抵现方案不合理或违反法律法规规定，小股东有权拒绝并寻求法律途径维护自己的权益。
- 在处理股东退股事宜时，建议双方保留相关证据，如协商记录、评估报告等，以备不时之需。
总结：小股东退股时，大股东让拿货抵现是否合法需根据具体情况判断。在处理此类事宜时，建议双方遵循公司章程、股东协议的约定以及相关法律法规和公平原则，确保处理方式的合法性和合理性。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。