用人单位若不配合劳动监察大队取证，可能会面临警告、罚款等行政处罚，情节严重的还可能被责令停产停业整顿，甚至被追究刑事责任。以下是对此问题的详细分析：
一、行政处罚
警告与罚款：
- 根据《劳动保障监察条例》第三十条，用人单位若存在不按照劳动保障行政部门的要求报送书面材料、隐瞒事实真相、出具伪证或者隐匿、毁灭证据等行为，劳动保障行政部门将责令其改正。
- 若用人单位拒不改正，或拒不履行劳动保障行政部门的行政处理决定，劳动保障行政部门将处以2000元以上2万元以下的罚款。
责令停产停业整顿：
- 在情节严重的情况下，如用人单位多次不配合劳动监察大队取证，或其行为对劳动者权益造成重大损害，劳动保障行政部门有权责令其停产停业整顿。
二、刑事责任
- 如果用人单位的不配合行为构成犯罪，如妨碍公务罪等，将依法追究其刑事责任。这通常涉及用人单位以暴力、威胁等方法阻碍劳动监察大队执行公务，或故意销毁、隐匿重要证据等严重违法行为。
三、其他后果
影响企业信誉：
- 用人单位不配合劳动监察大队取证的行为，可能会被记录在企业的信用档案中，影响企业的信誉和形象。
增加劳动纠纷处理难度：
- 不配合取证可能导致劳动监察大队无法全面、准确地了解事实真相，从而增加劳动纠纷的处理难度和时间成本。
四、建议与措施
积极配合调查：
- 用人单位应认识到配合劳动监察大队取证是其法定义务，应积极提供相关资料和证据，协助调查工作的顺利进行。
加强内部管理：
- 用人单位应建立健全内部管理制度，确保劳动用工行为的合法性和规范性，减少劳动纠纷的发生。
寻求法律帮助：
- 若用人单位对劳动监察大队的调查或处理决定有异议，应及时寻求法律帮助，通过合法途径维护自身权益。
举例说明：假设某用人单位因未按时支付员工工资被劳动监察大队立案调查。在调查过程中，该用人单位拒绝提供工资发放记录等相关证据，并试图隐瞒事实真相。劳动监察大队在多次警告无果后，依法对该用人单位处以罚款，并责令其限期改正。若该用人单位仍拒不改正，劳动保障行政部门将有权进一步采取责令停产停业整顿等措施。
总结：用人单位不配合劳动监察大队取证的行为将面临严重的法律后果，包括行政处罚和可能的刑事责任。因此，用人单位应积极配合调查工作，加强内部管理，确保劳动用工行为的合法性和规范性。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。