教师违纪立案阶段，并不意味着13个月的工资一定不发，这取决于具体的违纪性质、处理结果以及学校的规章制度。以下从几个角度为你详细分析：
违纪性质与处理结果：
- 如果教师的违纪行为较为轻微，且经过调查后并未构成严重违反学校规章制度或法律法规的情形，那么学校通常不会采取停发工资的措施。工资的发放与教师的违纪行为是否严重到需要停发工资是两个独立的问题。
- 如果教师的违纪行为严重，甚至涉嫌违法犯罪，且已经被立案调查，那么学校可能会根据内部规章制度或相关法律法规，对教师采取停职、停发工资等措施。但这也并非绝对，具体还需看学校的处理决定和法律法规的规定。
学校规章制度：
- 学校通常会有自己的规章制度，其中会明确规定教师在何种情况下会受到何种处罚，包括停发工资等。因此，要判断教师是否会因违纪立案而停发工资，还需要查阅学校的具体规章制度。
- 如果学校的规章制度中并未明确规定违纪立案会导致停发工资，那么学校就不能随意停发教师的工资。否则，教师有权向相关部门投诉或寻求法律援助。
法律法规依据：
- 根据《中华人民共和国劳动法》和《中华人民共和国劳动合同法》的相关规定，用人单位（包括学校）应当按时足额支付劳动者的工资，不得克扣或者无故拖欠。
- 如果学校因教师违纪立案而停发工资，且这一行为没有合法的依据或违反了相关法律法规，那么教师有权向劳动监察部门投诉或提起劳动仲裁，要求学校支付被停发的工资及相应的经济补偿。
建议与行动：
- 如果你作为教师面临这样的情况，首先应当查阅学校的规章制度，了解自己的权益和义务。
- 如果认为学校的处理决定不合法或不合理，可以向学校提出异议，并要求学校提供合法的依据。
- 如果学校坚持停发工资，且你无法与学校达成一致，可以向当地的劳动监察部门投诉或提起劳动仲裁，以维护自己的合法权益。
在整个过程中，如果你有任何疑问或需要进一步的法律帮助，可以直接向我咨询。我会根据你的具体情况，为你提供专业的法律建议和支持。