当事人申请陪审员回避的决定主体主要是人民法院院长。以下是对这一问题的详细分析：

一、决定主体的法律依据

根据《中华人民共和国人民陪审员法》第十八条及相关诉讼法规定，当事人在人民法院审判第一审普通程序案件中申请人民陪审员回避的，由院长决定。这一规定明确了院长在陪审员回避问题上的决定权，体现了院长在法院的领导地位，以及其对审判活动公正性和中立性的保障作用。

二、不同审判程序中的决定主体

1. 一审普通程序：

   • 在一审普通程序中，若当事人认为陪审员存在需要回避的情形，如与案件有利害关系或其他可能影响公正审理的关系，他们有权向法院提出回避申请。该申请由法院院长进行审查并作出决定。

2. 简易程序和基层法院一审独任制程序：

   • 目前，简易程序和基层法院一审独任制程序一般不适用人民陪审员制度。但若未来法律规定或实践中允许陪审员参与，也应按照对应诉讼法中关于审判人员回避的规则来确定决定主体，大概率也是由院长决定回避事项。

3. 特别程序等：

   • 在特别程序等非一审普通程序中，若涉及陪审员回避问题，需依据对应程序所适用的诉讼法中有关审判人员回避的规定来确定决定主体。多数情况下，审判人员（含陪审员）回避仍由院长决定。

三、回避申请与决定程序

1. 申请提出：

   • 当事人认为陪审员存在回避情形的，有权以口头或书面方式向法院提出回避申请，并应说明理由。回避申请应在案件开始审理时提出；若回避事由在案件开始审理后才知道的，也可以在法庭辩论终结前提出。

2. 暂停参与：

   • 被申请回避的陪审员在法院作出是否回避的决定前，应暂停参与本案的工作，以确保审判活动的公正性。但案件需要采取紧急措施的除外。

3. 决定作出：

   • 法院院长在收到回避申请后，应依法进行审查，并根据实际情况作出是否批准回避申请的决定。决定一旦作出，即具有法律效力，必须履行。

四、实际案例与法律建议

在实际操作中，若当事人认为陪审员存在回避情形，应及时向法院提出回避申请，并附上相关证据和理由。法院院长在收到申请后，会依法进行审查，并作出决定。若当事人对决定不服，可以在接到决定时申请复议一次，但复议期间被申请回避的人员不停止参与本案的工作。

总结来看，当事人申请陪审员回避的决定主体主要是人民法院院长，这一规定确保了回避决定的公正性和权威性。同时，明确的回避情形和申请程序也为当事人提供了有效的法律保障。若你在实际操作中遇到相关问题，可以直接向我咨询，我会根据你的具体情况提供详细的法律建议。